A phylogenetic study on the NP gene of detected canine distemper virus in (2008-2011) Iran

زمينه مطالعه: ‌بيماري ديستمپر سگ‌ها يك بيماري بسيار كشنده كه بسياري از گوشتخواران را مبتلا مي‌كند، مي باشد. هدف: اين مطالعه با هدف بررسي وضعيت اپيدميولوژيك ويروس ديستمپر سگ‌ها و ساختمان ژني آن در ايران صورت گرفت. روش كار:‌ در اين مطالعه با استفاده از تست واكنش زنجيره‌اي پليمراز داخلي، حضور ژن نوكليوپروتيين ويروس ديستمپر در نمونه‌هاي تهيه شده از 19 سگ داراي علايم بيماري ديستمپر، مورد مطالعه قرار گرفت(1390-1387.) نتايج: در نمونه هاي مختلفي از 14 سگ، ژن نوكليوپروتيين مورد شناسايي قرار گرفت. مطالعات فيلوژنتيكي انجام شده بر اساس بخشي از ژن نوكليوكپسيد، موجب شناسايي 2 شاخه ويروس ديستمپر كه بطور واضح با سويه واكسن متفـاوتنـد، در ايـران شـد. يـك شـاخـه، متعلـق بـه دستـه ويـروس‌هـاي ديستمپـر اروپـايـي و يـك شـاخه متعلق به دسته آركتيك مي‌باشد. نتيجه‌گيري‌نهايي: ‌با توجه به مطالعات فيلوژنتيك محدود موجود، بر روي وضعيت ژنتيكي ويروس ديستمپر در كشورهاي همسايه ايران، نمي‌توان به راحتي اجداد ويروس ديستمپر در ايران، بخصوص شاخه آركتيك را ريشه يابي كرد. اين مطالعه اولين مطالعه فيلوژنتيكي انجام شده بر روي ويروس ديستمپر سگ‌ها در ايران مي‌باشد.

Background: Canine Distemper (CD) is a lethal systemic disease affecting a wide variety of terrestrial carnivores. OBJECTIVES: This study was performed to survey epidemio-logical and molecular characteristics of the canine distemper virus (CDV) strains circulating in Iran. METHODS: In this study, 19 CDV-suspected unvaccinated dogs from Northeast and center of Iran were analyzed for presence of CDV nucleoprotein (NP) gene using Nested-PCR during 2008- 2011. Different biological samples of 14 dogs were positive. RESULTS: The phylogenetic analysis based on partial NP gene sequences indicated the presence of two major clusters that are clearly different from vaccine strains in Iran. One cluster belongs to the European group and the other one to the Arctic group. CONCLUTIONS: Due to a lack of phylogenetic analysis on CDV in countries bordering Iran, except Turkey, the ancestor of Iranian sequences specially Iranian Arctic sequences could not be definitely identified. This study is the first report on phylogenetic analysis of CDV from domestic dogs in Iran.