Phenotypic and genetic diversity of motile aeromonads isolated from diseased fish and fish farms

از بافت کليه 100 ماهي بيمار با علائم سپتي سمي هموراژيک و همچنين 50 نمونه آب از مزارع پرورش ماهي به صورت استريل تهيه و کشت باکتريايي صورت گرفت. هفتاد و پنج پرگنه باکتريايي گرم منفي به روش بيوشيميايي با استفاده از کيت API 20E به عنوان آئروموناس‌هاي متحرک مورد شناسايي قرار گرفتند. شناسايي ژنوتيپي اين باکتري‌ها با استفاده از پرايمرهاي اختصاصي rDNA S16 در واكنش زنجيره‌اي پليمراز و تعيين توالي نوکلئوتيدي، 28 آئروموناس متحرک مشخص شدند. در ماهي‌هاي بيمار، آئروموناس هيدروفيلا (3 جدايه، 15%)، آئروموناس ورونئي بيووار سوبريا (8 جدايه، 4%)، آئروموناس بيستاريوم/پسيکولا (5 جدايه، 25%)، آئروموناس مديا (3 جدايه، 15%)، آئروموناس جاندائي (1 جدايه، 5%)، آئروموناس آکواريوروم (0 جدايه، 0%) و در آب، آئروموناس هيدروفيلا (0 جدايه،0%)، آئروموناس ورونئي بيووار سوبريا (6 جدايه، 75%)، آئروموناس بيستاريوم/پسيکولا (0 جدايه، 0%)، آئروموناس مديا (1 جدايه، 5/12%)، آئروموناس جاندائي (0 جدايه، 0%)، آئروموناس آکواريوروم (1 جدايه، 5/12%) مشخص شدند. نتايج به دست آمده نشان داد وقوع سپتي سمي ناشي از آئروموناس‌هاي متحرک توسط آئروموناس ورونئي بيوار سوبريا بيشترين ميزان را به خود اختصاص داده است. نتايج حاصل از تعيين ترادف ناحيه rDNA S16 در آئروموناس‌هاي مورد آزمايش حاکي از وجود پلي‌مورفيسم نوکلئوتيدي داخل و بين گونه‌اي قابل توجهي (10 تا 20 جايگاه نوکلئوتيدي داراي پلي‌مورفيسم) در جمعيت آئروموناس‌ها بود.

Samples from the kidney of 100 diseased fish with signs of haemorrhagic septicemia and 50 samples from outlet water of fish farms were taken aseptically and cultured. In the laboratory, 75 colonies of gram-negative bacteria were biochemically diagnosed as motile aeromonads in our Bacteriology Laboratory Unit using API 20E rapid identification system. The genotype identification using specific primers for 16S rDNA by PCR and direct sequencing of 28 Iranian motile aeromonads isolates were as follow: in diseased fish, Aeromonas hydrophila (3 isolates, 15%), A. veronii bv. sobria (8 isolates, 40%), A. bestiarum/piscicola (5 isolates, 25%), A. media (3 isolates, 15%), A. jandaei (1 isolate, 5%), A. aquariorum (0 isolate, 0%) and in water, Aeromonas hydrophila (0 isolate, 0%), A. veronii bv. sobria (6 isolates, 75%), A. bestiarum/piscicola (0 isolate, 0%), A. media (1 isolate, 12.5%), A. jandaei (0 isolate, 0%) and A. aquariorum (1 isolate, 12.5%). Results of this study suggest that the incidence of motile aeromonads septicemia due to A. veronii bv. sobria is the most prevalent motile aeromonads. Nucleotide polymorphisms on the sequencing results of the 16S rDNA were detected as noticeable inter and intra-specific variation within the population of different aeromonads isolates. In total, 10-20 variant nucleotide positions in this region were observed among Aeromonas spp.