Title of article
A zeroone programming model for RNA structures with arclength 4
Author/Authors
SHIRDEL، G. H. نويسنده , , KAHKESHANI ، N نويسنده ,
Issue Information
دوفصلنامه با شماره پیاپی 0 سال 2012
Pages
9
From page
185
To page
193
Abstract
در اين مقاله، ساختارهاي RNA با طول كمان حداقل 4 را در نظر مي گيريم. ابتدا، اين ساختارها را به صورت مدل هاي ماتريسي و مسايل برنامه ريزي خطي صفر و يك ارايه مي دهيم و سپس، يك جواب بهينه براي اين مسيله با استفاده از روش شمارش ضمني بدست مي آيد. چنين جوابي با يك ساختار RNA با ماكزيمم تعداد پيوندهاي هيدروژني متناظر است.
Abstract
In this paper, we consider RNA structures with arc-length 4 ? . First, we represent these
structures as matrix models and zero-one linearprogramming problems. Then, we obtain an
optimal solution for this problemusing an implicit enumeration method. The optimal solution
corresponds toan RNA structure with the maximum number of hydrogen bonds.
Journal title
Iranian Journal of Mathematical Chemistry
Serial Year
2012
Journal title
Iranian Journal of Mathematical Chemistry
Record number
944886
Link To Document