مطالعه ترانسكريپتوم گياهان جو تلقيح شده با قارچ اندوفيت P. indica با استفاده از تكنيك درشت آرايه

شوری به عنوان یك تنش محیطی مهم، مانعی قابل توجه در برابر تولید جهانی محصولات زراعی به شمار میرود. قارچ P. indica به عنوان یك قارچ اندوفیت باعث تحریك رشد بسیاری از گونه های گیاهی گردیده و همچنین مقاومت به تنش های زیستی و غیر زیستی را افزایش می دهد. در این پژوهش، از آنالیز درشت آرایه به منظور شناسایی ژن های پاسخ دهنده به قارچ iP. indica و شناسایی مكانیسم های مولكولی مقاومت القاء شده توسط قارچ تحت تنش شوری استفاده شد. گیاهچه های جو (رقم پالاس) با قارچ تلقیح شده و 2 هفته بعد از تلقیح با 3 سطح شوری (صفر، متوسط و شدید) تیمار شدند. 4 هفته بعد از تلقیح، نمونه های برگی جمع آوری شده و آر. ان. ای استخراج شد. آنالیز درشت آرایه نشان داد كه تحت تنش شوری بیان 484 ژن در گیاهان تلقیح شده تغییر كرده است. نتایج نشان داد كه قارچ P. indica احتمالا با برنامه ریزی مجدد ترانسكریپتوم جو باعث القاء پاسخ سیستمیك به تنش شوری در گیاهان تلقیح شده می شود.

Salinity is a major environmental stress and is a substantial constraint to crop productivity worldwide. Piriformospora indica was shown to promote the growth of many plant species and also enhance resistance/tolerance to biotic and abiotic stresses. Macroarray analysis was applied to identify P.indica-responsive genes and molecular mechanism of fungus-mediated tolerance under salt stress condition. The barley seedlings (cultivar Pallas) were inoculated with P. inidca and 2 weeks after inoculation were treated with three salt stress levels (0 mM, 100 mM and 300 mM NaCl). Four weeks after inoculation, leaves samples were collected and RNA was extracted. Macroarray analysis showed that 484 genes were changed significantly in inoculated plants under salt stress. Our results showed that P. indica might induce systemic response to salt stress by reprogramming of barley transcriptome and metabolome