بررسي مكانيسم جاذبه بين ماكرومولكول هاي زيستي اف اكتين در حضور يون هاي مخالف چند ظرفيتي با شبيه سازي ديناميك مولكولي درشت دانه

Study of the mechanism of attraction between F-actin biological macromolecules in the presence of multivalent counterions using coarse-grained MD simulations

در اين مقاله جاذبه بين ماكرو مولكولهاي زيستي آف اكتين در حضور يون هاي مخالف چند ظرفيتي با استفاده از شبيه سازي ديناميك مولكولي بررسي شده است. در مدل مورد مطالعه نظم مارپيچي اف اكتين و درجه آزادي پيچشي و سختي پيچشي واقعي آن در نظر گرفته شده و يونهاي مخالف به طور صريح در شبيه سازي به كار برده شده است. با اينكه نتايج شبيه سازي اين مدل جاذبه بين ماكرو مولكول هاي با بار همنام را نشان مي دهد، مكانيسمي متفاوت از آنچه قبلا در مورد جاذبه بين اين رشته ها پيشنهاد شده است، مشاهده مي شود.

In this paper we study the mechanism of attraction between F-actin macromolecules in the presence of multivalent counter-ions using molecular dynamics simulations. F-actin helical order and its twist degree of freedom with its natural twist rigidity and explicit counterions are considered in our model. Although our results show attraction between these like-charged macromolecules, the observed attraction mechanism is different than that already has been reported