مطالعه مولكولي دو انانتيومر دلتا و لانداي كمپلكس نيكل ( II ) با DNA

در اين تحقيق مطالعات مولكولي براي يافتن بهترين مكان برهم كنش انانتيومرهاي دالتا و لانداي كمپلكس نيكل ) II ( با مولكول زيستي DNA صورت گرفته است. براي انجام محاسبات از نرم افزاراتوداك 2.4 استفاده شده است. ساختار DNA با شماره D 244 ، داراي توالي d (ACCGACGTCGGT) 2 از سايت RSCB گرفته شد و براي داكينگ مولكولي مورد استفاده قرار گرفت. ساختار كمپلكس 2+[Ni(phen)2(dppz)] از سايت كريستالوكرافي گرفته شد و در سطح محاسباتي LYP3B با مجموعه پايه LANL2DZ با نرم افزار گوسين بهينه شده و سپس براي محاسبات داكينگ مولكولي استفاده شده است. در تمامي محاسبات ساختار و كمپلكس به صورت سخت در نظر گرفته شده است. ابتدا براي پيدا كردن جايگاه فعال داكينگ كور انجام شده است و سپس 1/71* 9- كيلوكالري بر مول و ثابت اتصال برابر 117 / 9- و 7 / در جايگاه فعال داكينگ متمركز صورت گرفته است. انرژي آزاد اتصال 9 1 به ترتيب براي كمپلكس هاي دلتا و لاندا به دست آمده است. اما مكان برهم كنش در دو ايزومر با بازهاي /41* و 117 DNA متفاوت است. در هر دو ايزومر، برهمكنش ها از جنس برهمكنش هيدروفوبي غالب است.