اناليز بيوانفورماتيك اپيتوپهاي Bcell و Tcellدرپروتئين متصل شونده به كولين باكتري استرپتوكوكوس پنومونيا

پروتئين متصل شونده به كولين (CbpD)از پروتئينهاي سطح سلولي پنوموكوك است و هدف ما از اين مطالعه بررسي اين پروتئين بعنوان كانديد واكسن پروتئيني بر ضد پنوموكك ميباشد. بنابراين بااستفاده از ابزاربيوانفورماتيك اپيتوپهاي Bcell كانفورماسيوني وخطي و اپيتوپهاي Tcellدر اين پروتئين تعيين شد و از ميان آنها اپيتوپهايي كه قادر به القاي پاسخ ايمني محافظتي بودند، مشخص شدند. همپوشاني اپيتوپهاي حفاظتي در ناحيه شامل آمينو اسيد 2 تا 304 از پروتئين بالغ فاقد سيگنال پپتيد مشاهده شد و همولوگ اين قطعه در سروتيپهاي مهم بيماريزاي پنوموكوك با حداقل 97.8% همولوژي وجود داشته است. بنابراين قطعه مذكوركانديد مناسبي براي توليد واكسن با پوشش گسترده سروتيپي ضد پنوموكوك ميباشد.