شماره ركورد كنفرانس
4227
عنوان مقاله
پيشبيني عمق آمينواسيدها در توالي پروتئين با رويكرد يادگيري ماشين
پديدآورندگان
وثيقي مهدي vasighi@iasbs.ac.ir تحصيلات تكميلي در علوم پايه زنجان; , شبيهي محمد عباس m.abbasshabihi@iasbs.ac.ir تحصيلات تكميلي در علوم پايه زنجان;
تعداد صفحه
10
كليدواژه
بيوانفورماتيك , توالي پروتئين , عمق آمينواسيد , ماشين بردار پشتيبان.
سال انتشار
1395
عنوان كنفرانس
چهارمين كنفرانس ملي پژوهش هاي كاربردي در مهندسي كامپيوتر و پردازش سيگنال - cesp95
زبان مدرك
فارسي
چكيده فارسي
عمق آمينواسيد پارامتري است كه به طور غير مستقيم ميزان قرار گرفتن يك آمينواسيد در معرض حلال را نشان ميدهد و اطلاعات بهدست آمده همبستگي بالايي را با اطلاعات مربوط به سطح دسترسي قسمتهاي مختلف مولكول دارا ميباشد. اين اطلاعات بيانگر محل قرارگيري آمينواسيد در فضاي ساختاري پروتئين ميباشد. پيشبيني عمق آمينواسيدها با دقت بالا اهميت و كاربردهاي فراواني در شاخه بيوانفورماتيك ساختاري دارد. در اين پژوهش روشي مؤثر با استفاده از ماشين بردار پشتيبان، جهت تعيين رابطه بين توالي و عمق آمينواسيدها معرفي شده است. در روش پيشنهادي از هشت نوع متفاوت ويژگي كه از روشهاي متفاوت كد كردن بهدست ميآيند جهت نمايش توالي پروتئين به صورت سيگنال عددي استفاده ميگردد. همچنين عمق آمينواسيدها در چهار بازهي سطحي، نيمهسطحي، مياني و عميق در نظر گرفته شده است. با توجه به ويژگيهاي مربوطه و بازههاي تعريف شده براي عمق آمينواسيد، مدلي جهت طبقهبندي آمينواسيدها در يك رشته پروتئيني ساخته شد. دقت كلي روش پيشنهادي براي چهار بازه عمق تعريف شده برابر با 2/62 درصد بهدست آمد. بهبود قابل توجه نتايج بهدست آمده نسبت به روشهاي پيشين نشان از قدرت بالاي روش پيشنهادي در پيشبيني و بكارگيري ويژگيهاي مناسب جهت ساخت مدل طبقهبندي ميباشد.
كشور
ايران
لينک به اين مدرک