شناسايي ژن¬هاي اورتولوگ و بررسي فيلوژني پروتئين PIN2 در گونه¬هاي مختلف گياهي

از مهم¬ترين مراحل براي توليد گياهان تراريخته مفيد، شناسايي ژن¬هاي مهم و موثر در صفت مورد نظرمي¬باشد. PIN2 يك انتقال¬دهنده خارجي اكسين است كه باعث افزايش پنجه¬زني و كاهش ارتفاع در اثر افزايش بيان آن در برنج مي¬شود و بدين¬ترتيب نقش¬ مجزايي در كنترل شاخساره دارد. بعلاوه PIN2 نقش موثري در تعيين فنوتيپ ريشه دارد. تغيير¬ ميزان بيان PIN2 به¬وسيله ترانسفورماسيون ژنتيكي مي¬تواند مستقيما ساختار برنج را تغيير دهد كه در برنامه¬هاي اصلاحي حايز اهميت است. هدف اين مطالعه بررسي روابط تكاملي پروتئين PIN2 در 17 گونه گياهي و شناسايي اورتولوگ¬هاي اين ژن با احتمال عملكرد مشابه در گونه¬هاي مورد نظر است. به اين منظور، توالي پروتئيني PIN2 در گياهان مختلف از سايت NCBI استخراج و همرديف گرديد. نتايج نشان داد كه اين پروتئين داراي دومين محافظت شده در انتهايN و C مي-باشند كه اين دومين¬ها وظيفه شناسايي و انتقال هورمون اكسين از غشا را به عهده دارند و نواحي مركزي پروتئين در جايگيري صحيح پروتئين¬ها در غشاي فسفولپيدي نقش دارد. درخت فيلوژني با نرم¬افزار MEGA6 و با روش Neighbor joining رسم گرديد. نتايج اين درخت فيلوژني گونه¬هاي مورد بررسي را در 4 گروه مجزا قرار داد به¬طوريكه دولپه¬اي¬ها در سه گروه و با فاصله از گروه غلات قرار گرفتند.