بررسي بيوانفورماتيك آنزيم گاماتوكوفرول متيل ترنسفراز در گياه گوجه فرنگي

ويتامين‌ها وظايف ويژه و حياتي را در سيستم¬هاي مختلف بدن به عهده دارند و براي حفظ سلامتي بسيار مهم مي باشند. ويتامين E تنها در موجودات فتوسنتز كننده و برخي از سيانوباكتري‌ها توليد مي‌شود، بنابراين منبع تامين آن در انسان مصرف گياهان است. نام علمي ويتامين E، توكوفرول است كه به صورت تركيبي از هشت پيش¬ماده مرتبط وجود دارد كه فعال¬ترين آن¬ها از نظر بيولوژيكي آلفا توكوفرول مي¬باشد. در اكثر گياهان دانه روغني همچون دانه‌هاي سويا، كلزا و كنجد ميزان گاماتوكوفرول (پيش‌ماده آلفا-توكوفرول) نسبت به آلفاتوكوفرول بسيار بيشتر است. با توجه به اينكه آلفاتوكوفرول در ميان تمامي ايزوفرم‌هاي ديگر اين ويتامين داراي بالاترين فعاليت بيولوژيكي، و آنزيم گاماتوكوفرول متيل ترنسفراز آخرين آنزيم در مسير بيوسنتز آلفاتوكوفرول است در نتيجه افزايش توليد ويتامين E، هدف مهندسي گياهان تراريخت مي‌باشد. اين آنزيم در گياه گوجه¬فرنگي توسط يك ژن با طول bp 1089 كد مي¬شود كه از روي آن پلي¬پپتيدي شامل 362 اسيدآمينه با وزن مولكولي تقريبي 39814.5 دالتون ساخته مي¬شود و بررسي ساختار دوم توالي نشان داد كه اين پروتئين داراي 15 مارپيج آلفا، و 8 صفحه بتا و 23 كويل تشكيل شده است. همچنين مشخص گرديد كه پروتئين مذكور داراي پپتيد پيام با توالي MGSQCYSAYSIQSLNPTCPSSSSSSVIFSL براي انتقال به كلروپلاست است. اين يافته با حضور توكوفرول ها در كلروپلاست مطابقت دارد، به اين معني كه اين آنزيم بايد جهت تبديل گاما توكوفرول به آلفا توكوفرول، به مكان سوبستراي خود (درون كلروپلاست) حمل گردد.