جداسازي باكتري‎هاي اكسيد‎كننده‎ گوگرد با استفاده از محيط كشت هاي ميكروبي (چالش ها و چشم‎انداز آينده با تاكيد بر محيط هاي پرورشي آبزيان)

يكي از مشكلات اصلي در استخر‎هاي پرورش آبزيان توليد تركيبات گوگردي مضر از جمله سولفيد هيدروژن توسط متابوليسم باكتري‎هاي احيا كننده سولفات است. امروزه استفاده از باكتري‎هاي اكسيد كننده گوگرد به عنوان روشي موثر و مقرون به صرفه براي حذف سولفيد هيدروژن در مزارع پرورش ماهي پيشنهاد شده است. از اين رو، براي حذف بيولوژيكي اين گاز جداسازي، شناسايي و بررسي عملكرد موثر‎ترين باكتري اكسيد كننده سولفيد هيدروژن از آب و رسوب مزارع بسيار ضروري به نظر مي رسد. براي رسيدن به اين هدف بطور متداول از محيط كشت‎هاي مختلف استفاده مي‎گردد. علي رغم مزاياي استفاده از محيط كشت هاي مختلف براي انتخاب بهترين باكتري به منظور استفاده در مكمل هاي كود زيستي، چالش‎هاي زيادي در اين زمينه وجود دارد. يكي از مهم‎ترين چالش‎ها اين است كه تنها يك درصد ميكروارگانيسم‎هاي محيطي تحت شرايط آزمايشگاهي قابل كشت هستند و به دليل محدوديت‎هاي موجود در استفاده از محيط كشت ممكن است نتايج مطلوبي از عملكرد باكتري‎ها در شرايط طبيعي مشاهده نشود. بنابراين، براي ارزيابي و رشد ميكروارگانيسم‎هاي سخت رشد چندين تكنيك و روش جديد از جمله محفظه انتشار (Diffusion chamber)، تراشه جداسازي (Isolation chip)، متاژنوميكس (Metagenomics) و متاترانسكريپتوميكس (Metatranscriptomics) توسعه پيدا كرده است.