شناسايي و تعيين جايگاه فيلوژنتيكي باكتري عامل سوختگي باكتريايي پنبه در ايران

سوختگي باكتريايي پنبه با عامل Xanthomonas citri subsp. Malvacearum يكي از مهمترين بيماريهاي خسارتزاي پنبه در ايران و جهان مي باشد. در اين پژوهش تعداد 37 استرين جمع آوري شده از مزارع پنبه استانهاي گلستان و سمنان در سالهاي 83 و 84 به همراه يك جدايه استاندارد (86-217) تهيه شده از كلكسيون بين المللي ميكر وارگانيسمهاي جدا شده از گياهان، كه در آزمايشگاه پروكاريوتهاي موسسه تحقيقات گياهپزشكي تهران نگهداري مي شوند، استفاده گرديد. به منظور تعيين تنوع ژنتيكي و فيلوژني بهارگر، از تكنيك PCR و آغازگرهاي طراحي شده مرتبط با ژن gyrB استفاده گرديد. نتايج دندروگرام نشان داد كه بر مبري توالي هاي نوكلئوتيدي مربوط به ژن gyrB جدايهاي ايران با 100% تشابه در كنار ساير جدايهاي موجود در بانك ژن (NCBI) در يك گروه فيلوژني قرار گرفتند و از ساير باكتريهاي اين جنس از جمله X.oryzae و X.vasicola كاملا مجزا ميباشند. بنابراين اين روش در شناسايي و تفكيك دقيق جايگاه فيلوژنيك اين باكتري به عنوان روش مطمئن و حساس ارزيابي مي گردد ولي در تفكيك نژادهاي اين بهارگر موفق نبود.