بررسي و شناسايي miRNA هاي ريشه گياه برنج در شرايط نرمال و تنش خشكي

هاmiRNA، هايRNA كوچك 21-نوكلئوتيدي هستند كه نقش مهمي را در تنش هاي غيرزنده دارند . تا كنون تحقيق گسترده هاي به خصوص در ريشه براي شناسايي miRNA هايي كه در تنش خشكي تغيير بيان نشان مي دهند ، انجام نشده است . در اين تحقيق ، با استفاده از توالبايي با كارايي بالا، miRNA هاي مرتبط با تنش خشكي شناسايي شده است . در اين مطالعه ، تعداد 28469954 و 25048989 توالي به عنوان RNA كوچك به ترتيب براي كتابخانه هاي نرمال و خشكي شناسايي شد . بررسي پراكنش طولي RNA هاي كوچك نشان داد كه ، 21نوكلئوتيديها فراوانترين RNA هاي كوچك از نظر طولي هستند . نتايج نشان داد كه ، ترجيح نوكلئوتيدي در جايگاه اولين نوكلئوتيد براي Mirna هاي 21 نوكلئوتيدي اوراسيل و براي miRNaهاي 24 نوكلئوتيدي اوراسيل و آدنين است . در اين تحقيق تعداد 9298 عدد miRNA در مجمعوع هر دو كتابخانه شناسايي شد . فراوانترين miRNAها در كتابخانه ها به ترتيب miR168aj ، miR156a-J و MiR166a-d،F،n بودند . نتايج نشان داد كه هجده miRNA در اثر تنش خشكي افزايش بيان و سي و چهار miRNA كاهش بيان داشته اند . همچنين در miRNA هاي جديد شناسايي شده يازده و نه miRNA به ترتيب ،كاهش و افزايش بيان نشان داد ند . بررسي ژنهاي هدف miRNAها، تعداد 496ژن هدف از جمله Auxin response factorها را مشخص كرد . همچنين بررسي انتولوژي ژنها نشان داد كه اكثر اين ژنها در پروسه