بررسي بيوانفورماتيكي ژن MDHAR از گياه آلوروژوس ليتولاريس

مونودهيدروآسكوربات ردوكتاز يكي از آنزيمهاي مهم مسير آنتيا كسيدانت براي سميت زدايي راديكالهاي فعال اكسيژن (ROS) مي باشد و در مسير گلوتاتيون - آسكوربات براي احياي راديكال فعال مونودهيدروآسكوربات فعاليت مي كند . مطالعه ي حاضر به منظور بررسي ساختار و عملكرد آنزيم فوق، با استفاده از ابزار بيوانفورماتيك طراحي شد . بدين منظور توالي هاي مرتبط از بانك اطلاعاتي جمع آوري شده و با توالي ژن مذكور همرديف شدند . درخت فيلوژنتيك با كمك توالي هاي همرديف ترسيم و بسياري از مشخصات اين آنزيم از جمله توالي آمينواسيدي، موقعيت پروتئين در سلول ، نواحي موتيف ، درصد بازهاي موجود در توالي نوكلئوتيدي، ساختار ثانويه و ساختار سه بعدي آنزيم با استفاده از نرم افزارهاي مختلف ، مورد بررسي قرار گرفت . ژن مذكور داراي 1436 نوكلئوتيد با قابليت كد كردن 479 آمينواسيد مي باشد كه بيشترين شباهت را به گياهان سورگوم ، گندم، برنج و ذرت نشان داده است . آناليز ساختار پروتئيني، خارج سلولي بودن، درصد بيشتري از آبگريزي و نواحي موتيف pyr-redoxin و NAD-binding را اثبات مي كند . همچنين بررسي ساختار ثانويه، نشان دهنده ي 78/3 درصد ساختار مارپيچ آلفا، 41/1 درصد ساختار چين خورده ي بتا و 13/6 درصد ساختار دور بتا يا دور معكوس بوده است .