تأثير بيوفيزيكي ماده فعال سطحي آنيوني بر ديناميك رشد و پيشگويي محاسباتي كينازهاي تنظيم‌شده با سيگنال خارج‌سلولي در جلبك Dunaliella viridis

پژوهش حاضر به منظور ارزيابي سور فكتانت آنيوني SDS در شرايط مختلف محيطي بر ديناميك رشد جلبك دوناليلا ويريديس انجام گرديد. تاثير اين ماده با غلظت هاي 1.0 ، 1 و 10 ميلي گرم بر ليتر و اسيديته 7، 8، 9 و 10 بر محيط كشت دوناليلا مورد بررسي قرار گرفت. نرخ رشد جلبك در هر سه محيط حاوي دوزهاي مختلف از اين ماده در روز هاي ششم وهفتم مطالعه مقدار كمتر از 20٪ را نسبت به كنترل نشان مي دهد. نرخ رشد نسبت به شاهد در محيط كشت با غلظت 1 ميلي گرم در ليتر SDS وpH 8 در روز هفتم به حد 92٪ نزديك گرديد. فرآيند تخريب زيستي سور فكتانت علاوه بر متابوليسم سلولي بستگي به طول زنجيره آلكيله نيز خواهد داشت . زنجيره آلكيله با طول كوتاه SDS بيشترين در صد تخريب در جمعيت سلولي را ازخود نشان مي دهد. نتيجه ابن كه كاهش دانسيته سلولي ناشي از سورفكتانت در محيط كشت منجر به تاثير در چرخه سلولي دوناليلا گرديده كه بشدت وابسته به فسفريلاسيون ERK از MAPKs است. در اين تحقيق مدل ها در جهت پيشگويي ساختمان و عملكرد پروتئين بيشتر از الگوريتم همرديفي توالي ها بهره مند گرديده است. توالي هاي ERK نشان مي دهند كه رزيدو هاي آن ها قويا درريزجلبك‌هاي تك سلولي در گياهان وپستانداران عالي تر محافظت شده اند. ميزان همانندي بين توالي هاي مدل شده را با پروتئين كيناز هاي الگوي ERK1 و ERK2 ، در RMSD 2.30 و 2.09 آنگستروم با پوشش دهي با لاترين توالي محاسبه شده است.