بررسي تبارزايي دو جدايه‌ي ايراني ويروس موزاييك رگه‌اي گندم (Wheat streak mosaic virus) بر اساس ناحيه‌ي كد كننده‌ي پروتئيناز NIa-Pro

ويروس موزاييك رگه‌اي گندم (WSMV) Wheat streak mosaic virus از ويروس‌هاي خسارت زاي غلات مربوط به خانواده Potyviridae و جنس Tritimovirus است. در اين تحقيق، NIa-Pro كه يكي از مهم‌ترين پروتئينازهاي اين ويروس مي‌باشد، مورد مطالعه قرار گرفت. بدين منظور 116 نمونه‌ي علائم‌دار گندم از مزارع خراسان شمالي، خراسان جنوبي و آذربايجان غربي جمع آوري و به منظورشناسايي اوليه، كليه‌ي نمونه ها با آزمون الايزا آزمايش گرديدند و تعداد 10 نمونه در مقابل آنتي بادي اختصاصي WSMV واكنش مثبت نشان دادند. اين 10 نمونه‌ مثبت در گلخانه روي گياه گندم تكثير و با آغازگر اختصاصي مربوط به توالي كامل NIa-Pro در آزمون RT-PCR سنجش شده و قطعه‌اي به طول 732 جفت باز تكثير گرديد. سپس دو جدايه متفاوت از نظر جغرافيايي مربوط به آذربايجان غربي و خراسان شمالي، همسانه سازي و تعيين ترادف شد. در مقايسه‌ي ترادف‌هاي به دست آمده در اين تحقيق با ترادف هاي موجود در ژن بانك، دو گروه تشكيل شد. جدايه‌هاي ايراني مربوط به اين مطالعه در گروه يك، زير گروه IB و مجزا از جدايه‌هاي اروپايي و جدايه ايراني كه در تحقيقات پيشين تعيين توالي شده بود و نزديك به جدايه آمريكايي (NC-001886)، بودند قرار گرفتند. بررسي مكان‌هاي برشي در ژن NIaPro نشان داد كه مناطق برش، در اين پروتئين حفاظت شده است، جايگزيني تعدادي اسيد آمينه در مكان‌هاي حفاظت شده نظير تواليGKSH در محل 124-121، A/T در جايگاه 154و گلوتامين با آلانين در جايگاه 208 در جدايه‌هاي ايراني مشهود بود. تحقيق حاضر اولين بررسي جدايه‌هاي ايراني در ناحيه‌ي كد كننده مذكور مي‌باشد.