رديابي و تعيين خصوصيات ملكولي ويروئيد فرورفتگي ميوه سيب(Apple Dimple Viroid) در منطقه مراغه

در تابستان سال هاي 1395 و 1396 تعداد 73 نمونه با علائم مشابه با ويروئيد فرورفتگي ميوه سيب از ارقام گالا و رد دليشيز منطقه ي مراغه جمع آوري شد. RNA كل از پوست ساقه و برگ نمونه هاي جمع آوري شده حاوي علايم لكه هاي فرورفته و خال هاي زرد با حاشيه نامنظم روي پوست ميوه، استخراج گرديد و با استفاده از آغازگرهاي اختصاصي ژنوم كامل ويروئيد به طول 307-306 جفت باز با آزمون RT-PCR تكثير و ترادف 10 نمونه تعيين گرديد. جستجوي ترادف ها با BLASTn و هم رديف سازي آنها با ترادف هاي مربوطه در بانك ژن نشان داد كه جدايه هاي مورد مطالعه داراي بيشترين و كمترين يكساني ترادف به ميزان 100 و 74/4 درصد بترتيب با رس شمارهاي EF088662 (ايتاليا) و KF788291 (ايتاليا) مي باشند. بيشترين تفاوت نوكلئوتيدي در بين نواحي  CCRو TR قرار داشتند. آناليز فيلوژنتيك با روش حداكثر احتمال نشان داد كه جدايه هاي ايراني به همراه جدايه ها و واريانت هاي گزارش شده از ايتاليا در يك گروه قرار مي گيرند.