مطالعه ساختار و لايه‌بندي جمعيتي و ارتباط ژنومي هاپلوتيپي صفات كيفي پشم در گوسفندان نژاد زندي

An assessment of population stratification and haplotype based Genome-wide association for wool quality traits in Zandi sheep breed

زمينه مطالعاتي: شناسايي ژن­هاي بزرگ اثر، مؤثر بر صفات مهم اقتصادي يكي از مهم‌ترين اهداف اصلاح نژادي در پرورش گوسفند است. هدف: اين تحقيق به منظور بررسي ساختار و لايه­بندي جمعيتي و شناسايي جايگاه‌ها و ژن‌هاي مرتبط با صفات كيفي پشم، از طريق مطالعه ارتباط ژنومي هاپلوتيپي (GWAS) با استفاده از تراشه SNP ژنوم گوسفند (Illumnia SNPChip 50K Beadchip) در يك جمعيت گوسفند زندي بود. روش­كار: براي هر دام، صفات كيفي شامل: طول استاپل (SL)، ميانگين قطر الياف (MFD)، ضريب تغييرات قطر الياف (FDCV) و نسبت اليافي كه مساوي يا بيشتر از 30 ميكرومتر قطر الياف (F≥30) پشم اندازه‌گيري شد. پس از شناسايي اثرات ثابت معني­دار، مطالعه كنترل ژنوميكي (GC) با استفاده از آماره لامبدا و پويش ژنومي در نرم افزار PLINK نسخه 1.90 با استفاده از مدل خطي معمول (GLM) ارتباط هر يك هاپلوتيپ­ها با صفات كيفي پشم ارزيابي و براي كنترل نرخ اشتباه از تصحيح بنفروني استفاده شد. نتايج: يافته­هاي حاصل از كنترل ژنوميك لايه­بندي ضعيفي براي صفات كيفي پشم شامل SL، MFD، FDCV و F≥30 نشان داد كه حاكي از عدم وجود اختلاط ژنتيكي در جمعيت مورد مطالعه است. دو ناحيه هاپلوتيپي پيشنهادي در داخل ژن­هاي كانديدا ERBB2 و GNASواقع شدند كه پيشتر به ‌عنوان ژن‌هاي مؤثر بر رشد و توسعه مو و پوست در انسان گزارش گرديده بودند. نتيجه­گيري نهايي: ژن‌هاي كانديداي شناسايي‌شده، عملكرد مولكولي مرتبط با صفات الياف پشم داشتند. انتخاب براي بهبود كيفي در پشم توليدي در گوسفندان زندي با استفاده از اين يافته­ ها، باعث تسريع در پيشرفت ژنتيكي خواهد گرديد.