پايگاه‌هاي داده هاي اصلي جهت مطالعه بيان ژن ها در گياهان (مطالعه موردي: برنج)

برنج به‌عنوان يكي از مهم‌ترين گياهان زراعي، كوچك‌ترين ژنوم را در بين غلات دارد و به‌عنوان يك گياه مدل براي مطالعات ژنتيكي مطرح است. كوچك بودن ژنوم اين گياه باعث شده است كه مطالعات جامعي روي آن انجام شود و در نتيجه مقدار زيادي اطلاعات به دست آيد. جمع آوري و نگهداري مناسب اين اطلاعات (داده ها) و مديريت هر چه بهتر داده‌هاي حاصل از آزمايش هاي مختلف در قالب يك پايگاه داده ها، جهت دسترسي محققين به آن ها براي جلوگيري از دوباره‌كاري و نيز مقايسه نتايج خود با نتايج ساير محققين، از اهميت ويژه اي برخوردار است. براي رسيدن به اين هدف، مي‌توان از بيوانفورماتيك كمك شايان توجهي گرفت. بنابراين، ايجاد و توسعه پايگاه هاي داده‌هاي تخصصي و استفاده از ابزارهاي بيوانفورماتيك براي پردازش داده‌ها، سازمان‌دهي كارآمد، تجزيه و تحليل و تجسم آن‌ها امري ضروري است. در اين مقاله، پايگاه‌هاي داده هاي عمده براي مطالعه بيان ژن ها در سه سطح RNA، پروتئين و متابولوم در گياه برنج بررسي مي شود و ويژگي‌هاي اين پايگاه‌‌ها براي هر سطح مورد بحث و بررسي قرار مي گيرد.