خوشه بندي مبتني بر آنتولوژي ژن هاي هدف ريزRNA هاي مؤثر بر توليد شير

شير گاو مايعي بسيار مغذي است و بخش مهمي از رژيم غذايي يك فرد مي­ باشد و تمامي مواد مورد نياز بدن انسان را در خود دارد. استراتژي­ هايي كه از طريق آن مي­ توان توليد شير را تحت تأثير قرار داد، شناسايي ژن­ هايي كه روي توليد و تركيب شير اثر مي­ گذارند و استراتژي ديگر شناسايي ريزRNAهايي ­كه بيان ژن­ هاي مؤثر را تحت تأثير قرار مي ­دهند. در اين مطالعه ابتدا داده ­هاي ريزRNA­هاي مربوط به غده پستاني گاو شيري با كد شناسايي E-GEOD-61227از پايگاه GEO پياده­ سازي شدند. بعد از مشخص شدن ميزان بيان ريزRNAها، شناسايي ژن­ هاي هدف ريزRNA ها به كمك پايگاه داده ­اي miRwalk انجام گرديد. سپس براي فرآيند خوشه ­بندي ژن ­ها بر مبناي ساختار درختي آنتولوژي ژن كه شامل سه زير آنتولوژي فرآيند بيولوژيكي، عملكرد ملكولي و جزء سلولي است از نرم­ افزار AgriGO استفاده گرديد. در مطالعه حاضر براساس خوشه بندي مبتني بر آنتولوژي ژن ­هاي هدف نتايج نشان داد كه فعاليت ­هاي بيولوژيكي مورفوژنز بافت پستاني و تكثير سلول­ هاي اپيتليال در سطح بسيار معني ­داري مي ­باشند كه اين فرآيندها در تكامل و توسعه غدد پستان نقش بسيار مهمي دارند و نتايج براساس فعاليت مولكولي نشان داد كه سيگنال ­دهي با استفاده از پروتئين ­هاي گيرنده كينازي بيش ­ترين سطح معني­ داري به خود اختصاص داده است. هم­ چنين نتايج مربوط به بخش اجزا سلولي نشان داد بيش ­ترين شمار ژن ­هاي هدف در بخش داخلي غشا سلولي ارگانل و غشا پلاسمايي قرار دارند. بنابراين، ژن ­هاي هدفي كه تنظيم كننده اين فرآيندهاي معني­ دار مي ­باشند پتانسيل ايفاي نقش قابل توجه جهت يافتن راهكاري هدفمند در راستاي بهبود صفت توليد شير را دارند.

no abstract