آناليز بيوانفورماتيكي پروفايل‌هاي بيان افتراقي ژني مرتبط با استرس گرمايي در سه بافت مغز، كبد و ماهيچۀ ران جوجه‌هاي گوشتي مبتني بر تكنيك ريزآرايه

در صنعت پرورش طيور، استرس گرماييِ ناشي از دماي بالاي محيط، بر عملكرد حيوانات تأثير منفي دارد و به يك چالش اساسي تبديل شده است. آناليز پروفايل ترانسكريپتوم داده‌ها و شناسايي الگوهاي بيان افتراقي ژن در بافت‌هاي مرتبط مي‌تواند در كشف سازوكارهاي مولكولي مقاوم به استرس حرارتي نقش داشته باشد. در پژوهش حاضر، هدف اصلي استفاده از پروفايل ترانسكريپتوم سه بافت مغز، كبد و ماهيچۀ ران دو دسته از جوجه‌هاي گوشتي گروه كنترل و گروه تحت استرس گرمايي، بمنظور شناسايي ژن‌هاي كانديداي مرتبط با استرس گرمايي است. در تجزيه داده‌هاي ريزآرايه براي مقايسه بيان ژني، 657 ژن معني‌دار (P 0.05) استخراج شد كه در مجموع 94 ژن تفاوت بياني معني‌داري نشان دادند (FDR 0.05, Fold change ±2). سپس با بررسي حاشيه‌نويسي ژن‌هاي مربوطه حاصل از آناليز داده‌ها و مرور منابع و همچنين شبكه تعاملي پروتئين- پروتئين بازسازي شده، ژن‌هاي هاب شامل ژن‌هاي NSDHL، DHCR24، LSS، FDPS، PCK1، ACTA1، HSP90AA1، HSPA2، HSPB1، HSF1، CRYAB، APOB و IL6 شناسايي شدند. بررسي نتايج حاشيه‌نويسي اين ژن‌ها ثابت كرد كه در فرآيند اصلي مسيرهاي متابوليك و سيگنالينگ مرتبط با سيستم حمل‌و‌نقل يوني، بيوسنتز استروئيدها، آنتي‌بادي‌ها و كلسترول، متابوليسم ليپيدها، عملكرد سيستم ايمني بدن و مسيرهاي سيگنالي مختلف مانند كيناز MAP، RET  و ERK داراي نقش مي‌باشند. در نهايت پژوهش حاضر مي‌‌تواند اُفق جديدي از شواهد را با در نظر گرفتن مسيرهاي فعال شده توسط اين ژن‌ها براي شناسايي ژن‌هاي مؤثر و درك بهتر فرآيندهاي زيستي مرتبط با تنش گرمايي ارائه دهد.