بررسي مسير عملكردي ژن‌هاي هدف miRNAها در پاسخ به تنش‌هاي شوري و خشكي در كلزا

تنوع و پيچيدگي تنظيم miRNA نشان‌دهنده اهميت آن‌ها در فرآيندهاي زيستي است و بسياري از بخش‌هاي تنظيم miRNA مي‌توانند يك شبكه تنظيمي پيچيده miRNA mRNA را تشكيل دهند. بنابراين، تحقيق روي شبكه‌هاي تنظيم‌كننده miRNA mRNA مي‌تواند اطلاعات مفيدي را براي درك فرآيندهاي زيستي پيچيده ارائه دهد، كه براي مطالعه بيشتر مكانيسم‌هاي تحمل به تنش در گياهان به خصوص در گياه كلزا از اهميت بالايي برخوردار است. در اين پژوهش با استفاده از مرور مقالات انجام شده در زمينه تنش هاي غير زيستي انتخاب miRNA هاي مؤثر در تنش خشكي و شوري انجام گرفت و با استفاده از توالي‌هاي مربوط به miRNA‌‌هاي بالغ و به كمك نرم‌افزار آنلاين psRNATarget، شناسايي ژن‌هاي هدف انجام شد. ليست ژني از 225 ژن هدف شناسايي شده با كمك پايگاه UniProt تهيه شد. شناسايي مسير عملكردي آن‌ها با كمك پايگاه بيوانفورماتيك DAVID و سايتKEGG طبق پارامترهاي پيش‌فرض انجام گرفت. بررسي‌ها نشان داد كه اين ژن‌هاي هدف در مسيرهاي زيستي متعددي ازجمله ريبوزوم، اسپلايسوزوم، پروتئازوم، متابوليسم پورين، متابوليسم سلنوكامپاند و متابوليسم سولفور شركت داشتند. همچنين به منظور بررسي ژن‌هاي هم بيان از پايگاه داده STRING استفاده شد كه نشان‌دهنده وجود 37 ژن هم بيان در بين ژن‌هاي هدف شناسايي شده بود.