بررسي و آناليز ژن‌هاي پاسخگو به پاتوژن‌ها در سيب‌زميني ‏

عملكرد سيب‌زميني به عنوان يكي از منابع مهم در تأمين مواد اوليه غذايي و صنعتي در ايران و جهان، تحت تأثير پاتوژن‌هاي مختلف مي‌باشد. از بين اين پاتوژن‌ها، PVY،PVX و نماتد جزء اصلي‌ترين عوامل كاهش عملكرد هستند. مكانيسم مولكولي زمينه‌ساز مقاومت بيماري در سيب‌زميني تا حد زيادي ناشناخته باقي‌مانده است. در اين مطالعه، آناليز پروفايل‌هاي بيان ژن از مجموعه داده‌هاي GEO سه آلودگي پاتوژن در سيب‌زميني انجام شد و صفات مورفولوژيكي تحت چهار تنش مورد بررسي قرار گرفت. براي اين منظور 501 ژن مشترك با بيان متفاوت‌(DEGs) در دو آزمايش بر روي سيب زميني بررسي شد. تجزيه و تحليل غني‌سازي عملكردي نشان داد كهDEGs بيش‌تر در چرخه نيتروژن و متابوليكي اوليه، اتصال GTP و اتصال GTPase نقش دارند كه پس از تلقيح با پاتوژن‌هاي مختلف به طور مداوم تنظيم مي‌شوند. بر اساس آناليز صفات مورفولوژي تحت چهار تنش، PVY و برهم‌كنش PVX/PVY اختلاف معني‌داري را با ساير تنش‌ها (PVX و نماتد) بر روي اين صفات بر جاي گذاشت. از داده‌هاي ريزآرايه مربوط به سيب‌زميني استخراج شده از پايگاه داده GEO براي تجزيه و تحليل شبكه هم‌بيان ژن وزن‌دار (WGCNA) استفاده شد. بر اساس نتايج شبكه 2 گروه (ماژول) ژني به دست آمد كه پروفايل بيان آن‌ها در پاسخ به چهار تنش فوق‌الذكر همبستگي بالايي با يك‌ديگر داشتند. نتايج اين آزمايش بينش‌ ارزشمندي را در مورد مسيرها و ژن‌هاي تحت‌ تاثير ويروس‌هاي PVY، PVX، PVX/PVY و نماتد سيب‌زميني ارائه مي‌دهد كه ممكن است شناسايي ژن‌هاي مقاومت به بيماري‌هاي متعدد در سيب‌زميني را تسهيل كند.