مقايسه ژنوتيپي جدايه‌هاي اورنيتوباكتريوم رينوتراكئال جدا شده از ماكيان صنعتي ايران

اورنيتوباكتريوم رينوتراكئال (ORT)، باكتري نوظهور بيماري زاي تنفسي است كه خسارات اقتصادي مهمي را در صنعت طيور ايجاد مي‌كند.  مطالعات قبلي در ايران شباهت‌هاي مولكولي و ژنتيكي بالايي را بين جدايه‌هاي ORT طي سال‌هاي 1999-2009، براساس SDS-PAGE، ERIC-PCR و تعيين توالي ژن 16S rRNA نشان داد.  هدف از مطالعه حاضر تعيين ژنوتيپ جدايه‌هاي ORT به دست آمده از ماكيان صنعتي با استفاده از روش‌هاي تكثير تصادفي پلي‌مورفيسم DNA (RAPD) و تعيين تيپ توالي‌يابي چندجايگاهي (MLST) بود.  در اين مطالعه، از 30 باكتري ORT جدا شده از ماكيان صنعت طيور ايران در سال‌هاي 1379 تا 1395 تأييد شده به‌روش بيوشيميايي و مولكولي استفاده شد.  آزمايش RAPD با استفاده از پرايمر OPG11 بر روي تمام نمونه‌هاي ORT مورد مطالعه انجام شد.  با توجه به نتايج آزمون RAPD از بين 30 جدايه ORT تنها 5 جدايه براي آزمون MLST انتخاب شدند كه براي انجام آن، هفت جفت پرايمر براي تكثير و توالي‌يابي ژن‌هاي خانه‌دار adk، aroE، fumC، gdhA، mdh،pgi  و pmi طراحي گرديد.  در آزمون RAPD با استفاده از پرايمرOPG11 ، تعداد 9 ژنوتيپ متفاوت مشاهده شد.  توالي DNA الل‌هاي اين هفت لوكوس، در خصوص هر 5 سويه ORT، با توالي آلل‌هاي موجود در بانك اطلاعاتي MLST مقايسه شدند.  چهار ORT از پنج جدايه مورد مطالعه متعلق به تيپ سكانسي 9 (ST9) بودند و يك سويه هم تيپ سكانسي جديدي بود.  بر اساس يافته‌هاي اين مطالعه، يك تيپ سكانسي جديد از ORT هاي طيور صنعتي در ايران گزارش گرديد كه پيش از اين از ساير نقاط جهان گزارش نشده است.  مطالعات بعدي جهت بررسي تعداد بيش تري از جدايه‌هاي ORT، مي‌تواند در تشخيص تيپ‌هاي مختلف سكانسي و تيپ سكانسي غالب در كشور كمك‌كننده باشد.