ارزيابي بيوانفورماتيك تاثير miRNAها بر بيان ژن‌هاي دخيل در فرآيند سم‌زدايي در گورخر ماهي (Danio rerio)

گورخرماهي (Danio rerio) يك مدل ارزشمند براي مطالعه مكانيسم‌هاي مولكولي از جمله سم‌زدايي است. MicroRNA ها (miRNA)، مولكول هاي RNA غير كد كننده كوچكي هستند كه پس از رونويسي بيان ژن را تنظيم مي كنند و به طور بالقوه بر شبكه پيچيده ژن هاي درگير در مسيرهاي سم زدايي تأثير مي گذارند. در اين مطالعه، از تجزيه و تحليل بيوانفورماتيك (Target Scan و پايگاه داده DIANA) براي بررسي نقش بالقوه miRNA ها در تعديل و تنظيم بيان ژن‌هاي مرتبط با فرآيند سم‌زدايي در گورخرماهي استفاده شد. از طريق بررسي كامل مجموعه داده‌هاي miRNA و mRNA در گورخرماهي، miRNAهاي كانديد پيش‌بيني شده براي هدف قرار دادن ژن‌هاي سم‌زدايي شناخته شده شناسايي شد. سپس با استفاده از الگوريتم‌هاي بيوانفورماتيك، تعاملات بالقوه بين اين miRNA ها و ژن‌هاي سم‌زدايي هدف آن‌ها (pgp, gpx1a, gpx3, aldh3b1, gstm3, cyp3c1, gstp1, gpx1b, cyp17a1, sod1, sod2, gsto2, gstz1, akr7a3, gsr, ahr1b, cat, ahr2, abcb4, cyp11a1) مورد ارزيابي قرار گرفت . علاوه بر اين، ميزان حفاظت از تعاملات miRNA-هدف در بين گونه‌ها ارزيابي شد و مكان‌هاي بالقوه اتصال miRNA در مناطق ترجمه نشده 3’ (UTRs) mRNAهاي هدف مورد تجزيه و تحليل قرار گرفت. يافته‌هاي ما روابط تنظيمي پيچيده بين miRNA ها و ژن‌هاي دخيل در سم‌زدايي در گورخرماهي را نشان داد. اين نتايج مي‌تواند به عنوان پايه‌اي براي اعتبارسنجي‌هاي تجربي آينده باشد و به دانش رو به رشد، تنظيم ژن با واسطه miRNA  در زمينه مسيرهاي سم‌زدايي در گورخرماهي كمك كند.