كاربرد دنسيتومتري ژنومي براي محاسبه جمعيت نسبي باكتري اشريشيا كلي در روده ‌‌جوجه‌هاي گوشتي

Application of genomic densitometry for calculating the relative population of Escherichia Coli in the intestine of broiler chicks

در اين مطالعه روش دنسيتومتري براي محاسبه جمعيت نسبي باكتري‌هاي اشريشيا كلي در بخش‌هاي مختلف روده جوجه‌هاي گوشتي مورد بررسي قرار گرفت. پس از آماده‌سازي نمونه‌هاي محتويات گوارشي، فرآيند خالص‌سازي و استخراج DNA محتويات دوازدهه، ژيوژنوم، ايليوم و روده كور صورت گرفت. با استفاده از دو جفت آغازگر رفت و برگشت، يك واكنش زنجيره‌اي پليمراز اختصاصي جهت شناسايي اختصاصي كليه باكتري‌هاي اشريشيا كلي و يك واكنش زنجيره‌اي پليمراز اختصاصي براي شناسايي اختصاصي كليه باكتري‌هاي موجود در دستگاه گوارش جوجه‌ها انجام گرديد. با مقايسه و تجزيه و تحليل باندهاي مريي شده بر اساس رويه رگرسيون خطي با برون‌يابي با استفاده از تكنيك دنسيتومتري و نرم‌افزار Gel Proc Analyzer، تراكم باندهاي اختصاصي باكتري‌هاي اشريشيا كلي به‌دست آمد. جمعيت اين باكتري در سنين مختلف هم به تفكيك بخش‌هاي متفاوت دستگاه گوارش جوجه‌ها تعيين شد. نتايج آزمايش نشان داد 000004/0 درصد باكتري‌هاي دوازدهه، 07/0 درصد كل باكتري‌هاي ژيوژنوم، 64/0 درصد كل باكتري‌هاي موجود در ايليوم و 51/2 درصد باكتري‌هاي روده كور متعلق به گونه اشريشيا كلي بودند. همچنين باكتري اشريشيا كلي در چهار روزگي، 76/1 درصد كل باكتري‌ها، در چهارده روزگي 01/0 درصد كل باكتري‌ها و در سي روزگي 80/0 درصد كل باكتري‌هاي دستگاه گوارش جوجه‌ها را تشكيل مي‌دهند. علاوه بر اين معلوم شد در چهار روزگي در ژيوژنوم، ايليوم و روده كور به ترتيب 30/0، 05/2 و 97/3 درصد كل باكتري‌ها از گونه اشريشيا كلي بوده و در دوازدهه اين باكتري وجود نداشت. در چهارده روزگي هم در ژيوژنوم، ايليوم و روده كور به ترتيب 000009/0، 00011/0 و 08/0 درصد كل باكتري‌ها از گونه اشريشيا كلي بودند و در دوازدهه اين باكتري وجود نداشت. در سي روزگي هم در دوازدهه، ايليوم و روده كور به ترتيب 00011/0، 009/0 و 40/2 درصد كل باكتري‌ها از گونه اشريشيا كلي بودند و در ژيوژنوم اين باكتري وجود نداشت. به‌عنوان نتيجه‌گيري كلي شيوه دنسيتومتري مبتني بر نتايج PCR را مي‌توان روشي سودمند براي تعيين جمعيت نسبي باكتري‌هاي گونه اشريشيا كلي دستگاه گوارش طيور دانست.