پايش اينتگرون كلاس 1 در سويه‏هاي اشريشياكلي اسهال‏زا جدا شده از كودكان شهر ياسوج

Monitoring of class1 integrons in diarrheagenic E. coli strains isolated from children in Yasouj

 مقدمه: اينتگرون‏ها عناصر ژنتيكی متحركی هستند كه توانايی كسب و درج كاست‏های ژنی مقاومت آنتي‏بيوتيكي را دارند و نقش مهمی در گسترش مقاومت دارويی ايفا مي‏كنند. هدف از اين پژوهش، ارزيابی نقش اينتگرون كلاس 1 در مقاومت دارويی جدايه‏های اشريشياكلی اسهال‏زا در كودكان زير 5 سال است‏‏. ‏‏‏ مواد و روش‏‏ها: 164 جدايه‏ی اشريشياكلی اسهال‏زا در كودكان زير 5 سال از نظر حضور ژنintI1 و كاست ژنی درج شده در اينتگرون كلاس يك ارزيابي شد. همچنين، مقاومت آنتي‏بيوتيكی با استفاده از استاندارد CLSI بررسی شد. ‏‏‏ نتايج: ميزان شيوع ژن intI1 و كاست ژنی در جدايه‏های اشريشياكلی به ترتيب 73/70‏ و 63/64‏ درصد بود. اندازه كاست‏های ژنی در اين نمونه‏ها از 750 تا 2000 جفت باز متغيير بود. همچنين، بين حضور اينتگرون كلاس 1 و كاست ژنی آن و مقاومت نسبت به استرپتومايسين، جنتامايسين، كانامايسين، آميكاسين، كلرامفنيكل، تتراسايكلين، ناليديكسيك‏اسيد و كوتريموكسازول ارتباط معناداری به دست آمد. ‏‏‏ بحث و نتيجه‏گيری: نتايج اين پژوهش نشان داد كه اينتگرون كلاس 1 و كاست‏های ژنی درج شده در آن، در بين اشريشياكلي‏های اسهال‏زا در منطقه مورد پژوهش شيوع در خور توجهی دارد. با توجه به امكان شيوع گسترده سويه‏های مقاوم به دارو، ضرورت پايش مولكولی جدايه‏های ‏اشريشيا‏كلی در ساير مناطق كشور وجود دارد.

 Introduction: Integrons are mobile genetic elements able to acquire and integrate the antibiotic resistance gene cassettes and play an important role in the development of the drug resistant. This study assessed the contribution of class 1 integron in drug resistant diarrheagenic Escherichia coli strains, in children under 5 years. Materials and methods: 164 diarrheagenic E. coli strains isolated from children under 5 were evaluated to investigate intI1 gene and gene cassette. Furthermore the antibiotic resistance was determined using CLSI critria. Results: The rate of intI1 gene and gene cassette in Escherichia coli isolates were 70.73 % and 64.63 %, respectively. In these samples, gene cassette sizes varied from 750 to 2000 bp. There was a significant correlation between the presence of class 1 integron and resistance to streptomycin, gentamicin, kanamycin, amikacin, chloramphenicol, tetracycline, nalidixic acid and cotrimoxazole. Discussion and conclusion: The present study elucidates that the rampancy of class 1 integron and the incorporated gene cassettes is quite high among diarrheagenic E. coli in our area of research. Hence, considering the prospect of widespread break out of the drug-resistant strains of E.coli, further molecular analysis in different regions of the country is essential.