بررسي خصوصيات فنوتيپي و تنوع ژنتيكي جدايه هايPseudomonas syringae pv. syringae عامل شانكر باكتريايي بادام در استان خراسان رضوي با استفاده از BOX-PCR

شانكر باكتريايي كه بوسيله پاتوار­هاي Pseudomonas syringae Van Hallايجاد مي­شود يكي از مشكلات جدي باغ­هاي درختان ميوه هسته­دار مي­باشد. در اين تحقيق طي سال­هاي 1391-1390 نمونه هاي داراي علائم شانكر از باغات بادام در استان خراسان رضوي جمع آوري شده و جداسازي باكتري انجام شد. عامل بيماري براساس آزمون­هاي گروه LOPAT و GATTa، (Pss)Pseudomonas syringae pv. Syringae شناسايي شد. شانزده جدايه خالص ­سازي شده و مورد بررسي­هاي فيزيولوژيكي و بيوشيميايي قرار گرفتند. جدايه­ها براين اساس اختلافات جزئي نشان دادند. تشخيص مولكولي جدايه ها با واكنش زنجيره اي پلي­مراز با آغازگرهاي اختصاصي D21 و D22 صورت گرفت. به منظور ارزيابي دامنه تنوع ژنتيكي جدايه­ها، از روش BOX-PCR استفاده شد. از ضريب تشابه جاكارد (Jaccard) براي تعيين تشابه جدايه­ها و از روش UPGMA و نرم افزار NTYSYS-pc براي آناليز خوشه­اي استفاده شد. در آناليز خوشه­اي داده­ها، جدايه­ها با آغازگر BOXA1R در سطح تشابه 68 درصد، در 3 گروه قرار گرفتند. نتايج، بيانگر تنوع ژنتيكي جدايه­هاي عامل بيماري شانكر درختان بادام در استان خراسان رضوي است.