بررسي مقاومت آنتي‌بيوتيكي در گروه‌هاي فيلوژنتيك ايزوله‌هاي اشريشيا كلي عامل عفونت‌هاي ادراري در شهرستان شهركرد

Determination of phylogenic groups in uoropathogenic Esherichia coli in Shahrekord

چكيده سابقه و هدف: امروزه باكتري اشريشياكلي به عنوان غالب‌ترين عامل ايجاد كننده عفونت ادراري در 90-80 درصد از بيماران گزارش شده است. به طور معمول سويه‌هاي اشريشياكلي در 4 گروه فيلوژنتيك A،B1 ، B2و D تقسيم مي‌شوند. مواد و روش‌ها: در اين تحقيق 63 ايزوله اشريشيا كلي جدا شده از كشت ادرار بيماران مراجعه‌كننده به آزمايشگاه‌هاي تشخيص طبي شهرستان شهركرد، پس از تشخيص قطعي در حضور پرايمر اختصاصي 16srRNA جهت گروه‌بندي فيلوژنتيك با استفاده از روش پيشنهادي كلرمونت و همكاران مورد بررسي قرار گرفتند. يافته‌ها: پس از تاييد قطعي ايزوله‌هاي اشريشيا كلي در حضور پرايمر اختصاصي 16srRNA گروه فيلوژنيك A در 33 ايزوله (38/52%)، گروه D در 17 ايزوله (94/26%)، گروه B2 در 8 ايزوله (69/12%) و گروه B1 در 5 ايزوله (93/7%) گزارش گرديد. 51 ايزوله (95/80%) متعلق به جنسيت زن و 12 ايزوله (40/19%) متعلق به جنسيت مرد بودند. در تجزيه و تحليل آماري با توجه به آزمون دقيق فيشر، بين جنسيت و گروه فيلوژنتيك ارتباط آماري معني‌داري مشاهده نگرديد. نتيجه‌گيري: ايزوله‌هاي مورد بررسي در اين تحقيق بيشتر متعلق به گروه فيلوژنيك A بودند كه در مقايسه با ساير مناطق از نظر نوع گروه فيلوژنيكي متفاوت است. به نظر مي‌رسد كه با افزايش پروفايل مقاومت دارويي، تغيير از گروه B2 به سمت گروه A مشاهده شده است.

Abstract: Background and Aim: Urinary tract infections are the most common infectious diseases. Nowadays, Escherichia coli has been reported as the predominant cause of urinary tract infection in 80-90% of patients. Typically, strains of Escherichia coli are divided in to four phylogenetic groups: A, B1, B2 and D. Materials and Methods: In this study, 63 isolated E. coli from urine cultures of patients who were referred to clinical laboratories in Shahrekord, after certain diagnosis in the presence of specific primers 16srRNA, were studied to the phylogenetic grouping using suggested method by Clermont et al. Results: After detection isolates of E. coli in the presence of specific primers, 33 (52.38%), 17 (26.94%), 8 (12.69%) and 5 (7.93%) isolated E. coli were reported as A, D, B2 and B1 groups, respectively, after certain diagnosis E. coli in the presence of 16srRNA specific primers. 51 isolates (80.95%) belonged to female and 12 isolates (19.04%) belonged to male gender. In statistical analysis according to Fisher test, there is no significant relation between gender and phylogenetic group. ‍Conclusion: In comparison to other areas, E. coli strains isolated from urinary tract infection in Shahrekord more belonged to the phylogenetic group A, which were different in phylogenetic types. It seems that by increasing of drug resistance profile, changing from Group B2 to Group A have been observed.