جداسازي متانوبروي باكتر اسميتي از نمونه مدفوع انسان با استفاده از ژن اختصاصي rpoB

سابقه و هدف: آركي­ها ميكروارگانيسم­هاي اكستروترموفيل هستند كه سال­ها تصور بر آن بود كه تنها مي­توان آنها از محيط­هاي با شرايط دشوار از قبيل آتشفشان­ها ، اعماق اقيانوس­هاي و درياچه­هاي پرنمك به دست آورد. اما امروزه مشخص شده است كه دسته­اي از اين آركي­ها ساكن دستگاه گوارش موجودات زنده از قبيل پستانداران، سخت پوستان و انسان هستند. از مهم­ترين سويه شناسايي شده آركي­ها در دستگاه گوارش، مي توان بهMethanobrevibacter smithii اشاره كرد. در اين مطالعه، براي اولين بار آركي متانوژن به صورت بومي جداسازي شد. روش بررسي: در اين مطالعه DNA آركي از نمونه هاي مدفوع 20 فرد سالم با معيار هاي مورد نظراستخراج و سپس PCR آن در شرايط بهينه صورت گرفت، همچنين براي اطمينان از تكثير ژن مورد نظر (rpoB) هضم آنزيمي توسط آنزيم محدودكننده انجام شد و در انتها نمونه ها در داخل E.coli(DH5α) كلون و تعيين توالي شدند. يافته­ ها: از بين 20 نمونه مدفوع، در 18 نمونه جواب PCR (90%) مثبت گزارش شد. جواب­هاي مثبت به كمك آنزيم محدودالاثر AVAII تاييد شدند و نتايج سكانس در سايت NBCI بررسي شد و مشخص شد نمونه جدا شده آركي Methanobrevibacter smithii است. نتيجه­گيري: اين مطالعه نشان مي­دهد با توجه به تنوع ميكرورارگانيسم­ها در دستگاه گوارش، تعيين ژن اختصاصي و عدم داشتن همولوژي با ساير ميكروارگانيسم­ها در جداسازي آركي بسيار حايز اهميت است.