بررسي بيوانفورماتيكي ژن هاي خانواده ي عوامل رونويسي WRKY در گندم

خانواده ي ژني WRKY رمزكننده گروه بزرگي از عوامل رونويسي هستند كه در تنظيم ژن هاي پاسخ­دهنده به تنش هاي زيستي و غيرزيستي به خصوص در تنش خشكي دخيل مي­باشند؛ براي شناسايي اعضاء اين خانواده ژني در گندم، جستجوي چندگانه در پايگاه هاي اطلاعاتي مرتبط و tblastn براساس توالي­هاي حفظ شده ي اين خانواده در برنج در داده­هاي nr، EST، HTGS انجام شد. توالي­هايي مثل EST و cDNA (فاقد پروتئين) توسط نرم­افزارهاي DNAstar و NCBI ORF finder ترجمه شدند. هم رديفي و آناليز فيلوژنتيكي با استفاده از نرم افزارهاي MEGA4 و BioEdit انجام گرديد. الگوي بياني اين خانواده­ي ژني با استفاده از داده­هاي ريزآرايه و در پايگاه­هاي PLEXdb، GENEVESTGATOR بررسي شد. براساس نتايج به دست آمده، 94 عضو از خانواده­ي ژني WRKY در گندم يافت شد. براي 76 عضو پيدا شده ساختار حفظ شده خانواده WRKY به طور كامل وجود داشت و براي ديگر اعضاء توالي كامل پروتئين پيدا نشد. عوامل رونويسي WRKY در گندم همانند برنج بر مبناي ساختار دمين حفاظت شده WRKY به سه گروه تقسيم شدند. 7 عضو از اين خانواده، با توجه به بيان افتراقي آن ها در پاسخ به تنش خشكي در ارقام حساس و متحمل گندم، به عنوان ژن­هاي منتخب براي افزايش تحمل به خشكي در گندم انتخاب شدند.