بررسي بيوانفورماتيكي و بيان خانواده ژني SnRK2 در گياه جو

تنش هاي غيرزيستي از مهم ترين عوامل محدود كننده ي عملكرد گياهان زراعي و پروتئين كينازهاي SnRK2 از تنظيم كننده هاي كليدي پاسخ گياهان به تنش هاي غيرزيستي مي باشند. با توجه به اهميت اقتصادي، سطح زير كشت و تحمل گياه جو به تنش هاي غيرزيستي، در اين تحقيق اعضاي خانواده ي SnRK2 در گياه جو شناسايي و مورد بررسي قرار گرفته اند. به همين منظور توالي هاي حفظ شده خانواده SnRK2 در پايگاه هاي اطلاعاتي مختلف همچون NCBI و پروژه ژنوم جو، با ابزار tBLASTn در بين توالي هاي ثبت شده براي گياه جو جستجو شدند. در نتيجه 10 عضو يافت شدند HvSnRK2.1) تا HvSnRK2.10) كه 8 عضو آن تاكنون گزارش نشده بودند. اعضاي خانواده ي SnRK2 جو با اعضاي اين خانواده در آرابيدوپسيس و برنج همرديف و درخت فيلوژنتيك رسم شد. تعيين جايگاه كروموزومي، آناليز پروموتر و تعريف ساختار ژن ها انجام شد و الگوي بيان هر ژن در اندام ها، تيمارها و ارقام مختلف بر اساس داده هاي ريزآرايه مورد بررسي قرار گرفت. نيمي از اعضاي اين خانواده روي كروموزوم 2 و بقيه روي كروموزوم هاي 1، 4، 5 و 6 قرار داشتند. تعداد اينترون در اعضاي اين خانواده از صفر تا 8 متغير بود. 19 نوع عامل سيس شامل عوامل موثر در پاسخ به تنش هاي غيرزيستي، بر روي پروموتر اعضاي خانواده ژني HvSnRK2 شناخته شد. بيان ژن HvSnRK2.6 توسط خشكي، شوري و سرما القا شده و به نظر مي رسد در انتقال پيام اين تنش ها و ايجاد تحمل به آنها نقش مهمي ايفا كند. اميد است بتوان از اين ژن براي اصلاح و دست ورزي گياهان در جهت تحمل به تنش هاي غيرزيستي به ويژه خشكي بهره برد.