توالي نوكلئوتيدي و آناليز فيلوژنتيكي ژن گليكوپروتئيني ويروس سپتي سمي هموراژيك ويروسي (VHS) جداشده از ماهيان قزل‌آلاي رنگين‌كمان استان چهار محال و بختياري

Nucleotide sequencing and phylogenetic analysis of glycoprotein gene of viral hemorrhagic septicemia virus (VHSV) isolated from rainbow trout in Chaharmahal and Bakhtiary province

مقدمه: سپتي سمي هموراژيك ويروسي به‌عنوان جدي‌ترين بيماري ماهي قزل‌آلاي رنگين‌كمان درصنعت آبزي‌پروري شناخته شده است. در مطالعۀ حاضر ژن گليكوپروتئيني ويروس سپتي سمي هموراژيك ويروسي (VHS) شناسايي شد، و تعيين توالي و آناليز فيلوژنتيكي برخي ويروس‌هاي جداشده از ماهيان قزل‌آلاي رنگين‌كمان كشور انجام شد‏. ‏‏ مواد و روش‏‏ها: نمونه‌هاي مشكوك به بيماري VHS كه از مزارع پرورش قزل‌آلاي رنگين‌كمان استان چهارمحال و بختياري جمع‌آوري شده بود با استفاده از آزمون (RT PCR) Reverse transcriptase PCR سنجش شد. در اين ميان هشت نمونه به‌عنوان سويۀ مثبت شناسايي شد. در اين تست، ژن گليكوپروتئيني (G) ويروس رديابي گرديد و جهت تعيين رديف نوكلئوتيدي تعيين توالي شد. نتايج حاصل از مقايسۀ رديف نوكلئوتيدي تعيين‌شده در اين مطالعه با توالي شناخته‌شدۀ ژن گليكوپرتئيني ساير ويروس‌ها مطالعۀ فيلوژنتيكي شد. ‏‏ نتايج: نتايج حاصل از مطالعۀ حاضر نشان داد كه بين صفر تا 4/7 درصد تنوع ژنتيكي در ژن گليكوپروتئيني وجود دارد و در اين ميان بيشترين قرابت با رديف نوكلئوتيدي ژن گليكوپروتئيني درآلمان (توالي EU708818) با 100درصد تشابه و كمترين قرابت مربوط به جدايه‌هاي اين ويروس در ژاپن (توالي AB672616) و تركيه (تواليJF415091) هر كدام با 60/92 درصد قرابت مشاهده شد. ‏ بحث و نتيجه‏گيري: با توجه به قرابت ژنتيكي ويروس‌هاي VHS جداشده از ايران با سويه‌هاي اروپائي به‌ويژه آلمان و فرانسه احتمال وجود ارتباط بين شيوع بيماري VHS ايران و تخم‌هاي چشم‌زدۀ وارداتي از كشورهاي ذكرشده وجود دارد‏. ‏‏

Introduction: Viral hemorrhagic septicemia (VHS) is known as the most serious disease of rainbow trout in aquaculture industry. In this study, VHS virus glycoprotein genes were identified in farmed rainbow trout by RTPCR test. Then nucleotide sequencing and phylogenetic analysis were performed on the viral isolates. Materials and methods: Suspected samples of VHS disease that collected from rainbow trout farms of Chaharmahal and Bakhtiari province were tested by RTPCR method. Finally, the eight samples were identified as positive VHS strains and nucleotide sequencing was accomplished. Based on phylogenetic analysis, results of nucleotide sequences of glycoprotein gene were compared with other countries. Results: The results of present study showed that genetic variation in the glycoprotein gene was 07.4 percent. There was the highest similarity of glycoprotein gene of Iranian strains up to 100% with Germany strain (EU708818) and the lowest similarity was showed in Japan (AB672616) and Turkey (JF415091) strains with 60/92 percent in each. Discussion and conclusion: According to the genetic similarity of the VHS virus isolated from Iran with European strains, especially Germany and France, there is possibility of the relationship between the outbreak of VHS and eyed eggs imported from the mentioned countries.