Genotyping of PRNP coding region for scrapie in Indian sheep

پريون‌ها پاتوژن‌هاي عفوني بي‌نظيري هستند که از طريق مکانيسمي کاملا جديد سبب گروهي از بيماري‌هاي نورودژنراتيو کشنده مي‌گردند. عمدتا تغيير ساختار فضايي در پروتئين پريون منجر به تغيير پروتئين مارپيچ آلفا به فرم صفحه بتا مي‌گردد كه سبب اسکرپي در گوسفند و بز مي‌شود. مطالعه براي تشخيص پلي‌مورفيسم‌هاي ژن پروتئين پريون (PrP) در کدون‌هاي (136، 154 و 171) مسؤول حساسيت و مقاومت به بيماري اسکرپي در گوسفند انجام گرفت. ARQ فراوان‌ترين الل است که کمتر حساس بوده، اما ممکن است اسکرپي را دريافت کند. الل‌هاي بسيار حساس VRQ و مقاوم ARR در گوسفندان مانديا وجود نداشتند. ژنوتيپ‌هاي ARQ/ARQ، ARQ/AHQ و AHQ/AHQ در جمعيت مورد بررسي به ترتيب 40%، 40% و 20% يافت شدند که نشان دهنده مقاومت کم به اسکرپي و نياز به انتخاب دقيق به هنگام استفاده جهت جفت‌گيري مي‌باشد. شش گروه (واريانت) در SSCP يعني چندشکلي ساختار فضايي تک رشته‌اي يافت شد؛ از هر گروه يک نمونه تعيين توالي شد. تعيين توالي (شماره مسلسل KF2078-79) نمونه‌ها امکان شناسايي پنج چند شکلي جديد بر روي ژن PrP در موقعيت‌هاي کدون 98(S/R)، 147(D/E)، 175(Q/R)، 184(N/H) و 189(Q/L) را فراهم نمود. فقدان الل ARR در گوسفندان مانديا بايستي براي پياده‌سازي برنامه انتخاب پيشگيرانه به منظور جلوگيري از فرسايش ذخاير ژنتيکي مورد توجه قرار گيرد.

Prions are unprecedented infectious pathogens that cause a group of invariably fatal neurodegenerative disease by an entirely novel mechanism. The conformational change in prion proteins results in a change from a predominantly α-helical protein to a β-sheet form, which causes scrapie in sheep and goat. The present study was carried out to identify polymorphisms of the prion protein gene (PrP) at the codons (136, 154 and 171) responsible for the susceptibility and resistance of the scrapie disease in the sheep. The ARQ is the most frequent allele which is less susceptible, but may get scrapie. The highly sensitive VRQ and resistant ARR alleles were not present in the Mandya sheep. Genotype ARQ/ARQ, ARQ/AHQ, and AHQ/AHQ were found in the analyzed population with 40.00, 40.00 and 20.00% respectively, showing little resistance to scrapie and require careful selection when used for breeding. Six groups (variants) were found in SSCP (single-strand conformation polymorphism) i.e., out of each group one sample was sequenced. Sequencing (accession No. KF207876-79) of samples allowed the identification of 5 other new polymorphisms on PrP gene at codon positions 98(S/R), 147(D/E), 175(Q/R), 184(N/H) and 189(Q/L). Absence of ARR allele in the Mandya sheep should be taken into considerationfor the implementation of a preventive selection programme to avoid erosion of the genetic stock.