Title of article :
PCR-based markers for identification of some allelic variation at Glu-1 and Glu-3 loci in common wheat
Author/Authors :
Mehrazar، Elham نويسنده Department of Agronomy and Plant Breeding Sciences, College of Aburaihan, University of Tehran, P.O.Box, Tehran, Iran , , Izadi-Darbandi، Ali نويسنده University of Tehran , , Mohammadi، Mohsen نويسنده Seed and Plant Improvement Institute, Cereals Research Department, Karaj, Iran , , Najafian، Goodarz نويسنده Seed and Plant Improvement Institute, Cereals Research Department, Karaj, Iran ,
Issue Information :
دوفصلنامه با شماره پیاپی 0 سال 2014
Abstract :
انتخاب به كمك نشانگر روشي مناسب جهت به‌گزيني و ارزيابي ژنتيكي ژرم پلاسم است. خواص ريولوژيكي آرد با تنوع زير واحدهاي گلوتنين با وزن مولكولي بالا و پايين گندم همبستگي دارد. در اين تحقيق با استفاده از روش هاي SDS-PAGE و PCR الگوي زيرواحدهاي گلوتنين و نشانگرهاي اختصاصيDNA مرتبط به آنها در 60 لاين پيشرفته و واريته گندم با منشا جغرافيايي متفاوت بررسي شدند. نشانگرهاي اختصاصي DNA به اندازه‌هاي 1319، 669 و 450 جفت باز به ترتيب براي آلل‌هاي 2، 18+17 و 10+5 مكان ژني Glu-1 تكثير شدند. در واريته‌هاي گندم مورد مطالعه، آلل‌هاي ذكر شده بيشترين فراواني را در جايگاه ژني Glu-1 نشان دادند. در لاين‌هاي پيشرفته بيشترين فراواني مربوط به آلل‌هاي Null، 8+ 7و 10+5 بود. واريته‌هاي مطالعه شده از نظر ارزش نانوايي بصورت خوب (23 درصد با نمره 10)، متوسط (40 درصد با نمره 9-8) و ضعيف (37% با نمره 7-4) طبقه‌بندي شدند. اين ارزش در لايه‌هاي پيشرفته به ترتيب صورت 18 درصد خوب، 44 درصد متوسط و 48 درصد ضعيف ثبت شدند. تعداد 10 نشانگر اختصاصي DNA، با استفاده از PCR براي آلل‌هاي Glu-B3 شناسايي شدند. در مكان ژني Glu-B3 براي واريته‌هاي بررسي شده آلل‌هاي i، a، bو dبه ترتيب با 24، 21، 20 و 12 درصد بيشترين فراواني را نشان دادند. نشانگرهاي اختصاصي DNAبا اندازه‌هاي 621، 1096، 1570 و 662 جفت باز براي آلل‌هاي ياد شده توليد شدند. در مكان ژني Glu-B3 آلل‌هاي a، iوd به ترتيب با 25، 26 و 21 درصد بيشترين فراواني را در لاين‌هاي پيشرفته گندم داشتند. از نتايج اين تحقيق در پيشبرد برنامه اصلاحي گندم جهت بهبود كيفيت ارزش نانوايي و توليد ارقام جديد استفاده خواهد شد
Abstract :
Marker assisted selection (MAS) is a tool for breeding, screening, and genetic characterization of
germplasm. Allelic variation of both high and low molecular weight glutenin subunits (HMW/LMW-GS)
is associated with the rheological properties of wheat flour. In this study, we investigated glutenin pattern
using SDS-PAGE and their PCR based on DNA markers in 60 advanced wheat lines and cultivars with
different origins. Specific DNA markers regarding to Glu-1 loci, such as 1319 bp, 669 bp and 450 bp
fragments were respectively validated for 2*, 17+18, 5+10 alleles. These alleles showed the highest
allelic percentage in Glu-1 loci in studied cultivars. However the Null, 7+8 and 5+10 alleles showed the
highest allelic percentage in advanced lines. In this study, 23%, 40% and 37% of cultivars respectively,
got good (10), moderate (8-9) and weak (4-7) quality scores. In advanced lines, 18%, 44% and 38% got
good, moderate and weak quality scores respectively. Ten specific DNA PCR markers were also detected
for genotyping Glu-B3 alleles. The most frequent Glu-B3 alleles in wheat cultivars were i, a, b and d with
24%, 21%, 20% and 12%, respectively.Specific PCR markers regarding to the reported Glu-B3 alleles
were produced as 621bp, 1095bp, 1570 bp and 662bp consequently. The most frequent Glu-B3 alleles in
advanced lines belonged to a, i and d alleles with 35%, 26% and 21% respectively. The results provided
useful information for breeding program to improve breadmaking quality and develop new cultivars
Journal title :
Journal of Plant Molecular Breeding
Journal title :
Journal of Plant Molecular Breeding
