Title of article
Involvement of Cytosine DNA methylation in different developmental stages of Aeluropus littoralis
Author/Authors
Hashemi-Petroudi، Seyyed Hamidreza نويسنده Genetic and Agricultural Biotechnology Institute of Tabarestan, Sari University of Agricultural Sciences and Natural Resources, Iran , , Nematzadeh، Ghorbanali نويسنده , , Askari، Hossein نويسنده , , Ghahary، Saeed نويسنده Department of Agronomy, Tarbiat Modares University, Iran ,
Issue Information
دوفصلنامه با شماره پیاپی 0 سال 2014
Pages
12
From page
56
To page
67
Abstract
متيلاسيون DNA يكي از راههاي اپيژنتيكي تنظيم ديناميكي بيان ژن در سطح ژنوم بوده كه از نقش كليدي در مراحل مختلف نمو و تمايز برخوردار ميباشد. به منظور ارزيابي جايگاه متيلاسيون DNA در تحليل واكنش گياه شورپسند littoralis Aeluropus به شرايط مختلف نموي، از چندشكلي ناشي از متيلاسيون (MSAP) استفاده گرديد. ميزان تغييرات اپيژنتيكي بصورت متيلاسيون و دمتيلاسيون در جايگاه CCGG با استفاده از مقايسه الگوي باندي ناشي از آنزيمهاي HpaII و MspI بررسي گرديد. باندهاي تيپ I (عدم متيلاسيون)، تيپ II (متيلاسيون در جايگاه CpG)، تيپ III (متيلاسيون در جايگاه CpCpG) به ترتيب 7/75 درصد، 4/19 درصد، 9/4 درصد از كل اين باندها را به خود اختصاص دادند. بيشترين فراواني متيلاسيون (%4/19) در باندهاي تيپ II بوده كه در نوكلوتيد سيتوزين در هر دو رشته توالي پاليندرومي متيله گرديد. از 480 باند مشاهده شده، 33 باند در مراحل مختلف نموي از الگوي متيلاسيون متفاوتي برخوردار بودند. تنظيمات اپيژنتيكي در اين تحقيق دوجهته و بصورت تغييرات متيلاسيون و غيرمتيلاسيون بوده كه در مجموع روند افزايشي در ميزان متيلاسيون در طي فرايند نمو گياه مشاهده گرديد. تغييرات متيلاسيون و دمتيلاسيون مشاهده شده در جايگاه CG، ميتواند در تنظيم بيان ژن وابسته به مراحل مختلف نموي نقش داشته باشد
Abstract
DNA methylation as epigenetic mark plays a key role in normal differential and developmental processes
as well as in dynamic gene regulation at the genomic level. To assess DNA methylation pattern in
different developmental stages of Aeluropus littoralis, methylation sensitive amplified polymorphism
(MSAP) was used. Methylation and demethylation status at the CCGG recognition site were tracked by
two sets of cytosine methylation-sensitive enzymes (MspI and HpaII), which were classified into three
types. The percentage of total bands per type I (non methylation), type II (CpG methylation) and type III
(CpCpG methylation) fragments were 75.7, 19.4 and 4.9, respectively. The most frequent methylation
events (19.4%) were observed in type II fragment in which full methylation pattern occurred. Out of 480
bands, 33 bands showed methylation alterations between differential developmental stages in all three
types of detectable methylation levels. In this study, polymorphic bands had two main directions
associated with methylation or demethylation patterns in which methylation level increased during plant
development. The methylation and demethylation events at CG sites could be related to developmental
stage-specific gene regulation
Journal title
Journal of Plant Molecular Breeding
Serial Year
2014
Journal title
Journal of Plant Molecular Breeding
Record number
2010274
Link To Document