Genotyping of Fusarium verticillioides strains producing fumonisin B1 in feed associated with animal health problems

فوزاريوم ورتيسيليوئيدس نه تنها يک بيماريزاي اوليه براي ذرت است، بلكه قادر به ايجاد بيماري در ساير محصولات کشاورزي مثل سورگوم مي‌باشد. بيماريزايي آن مربوط به توليد توکسين‌هاي قارچي مثل فومينيزين است. در مطالعه حاضر، 24 جدايه از فوزاريوم ورتيسيليوئيدس که قبلا بر اساس مشخصات فنوتيپي تعيين هويت شده بودند مجددا با استفاده از آناليز پلي‌موفيسم طول قطعه محدود تعيين هويت گرديدند. تجزيه فرآورده‌هاي واكنش زنجيره‌اي پليمراز با آنزيم محدود کننده TASI باعث شناسايي چهار سويه غير ورتيسيليوئيدس شده که از مطالعه ما خارج شدند. تنوع ژنتيکي ميان 20 سويه باقيمانده از فوزاريوم ورتيسيليوئيدس به روش RAPD-PCR و با چهار پرايمر آناليز گرديدند. از چهار پرايمر آزمايش شده، دو پرايمر الگوهاي تقويتي چند شکلي را ايجاد کردند. دندروگرام مربوط به هر پرايمر، فاصله سويه‌ها را از هم نشان داد. با استفاده از پرايمرهاي A، B، C و D، جدايه‌ها به ترتيب به هشت، نه، هفت و هفت گروه تقسيم شدند. نتايج اين مطالعه ارتباط ژنتيکي ميان الگوهاي چند شکلي DNA با مناطق جغرافيايي و شدت توليد فومينيزين B1 را نشان داد. به نظر مي‌رسد که روش RAPD يک تکنيک مناسب براي تاپينگ سويه‌هاي فوزاريوم ورتيسيليوئيدس است.

Fusarium verticillioides (F. verticillioides) is not only a primary pathogen of maize, but also can cause disease in other crops such as sorghum. Pathogenicity is related to mycotoxin production such as fumonisin. In the present study, 24 isolates of F. verticillioides, which were previously identified by phenotype based methods, were re-identified using restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis. Digestion of the polymerase chain reaction (PCR) products with the restriction enzyme TasI allowed identifying four non-verticillioides strains that were discarded from our study. The genetic variations among the remaining 20 strains of F. verticillioides were analysed by random amplified polymorphic DNA (RAPD)-PCR method with 4 primers. Of the four primers tested, two primers produced polymorphic amplification patterns. Dendrogram for each primer indicated the distance of the strains to each other. Using primers of A, B, C and D, the isolates were divided to 8, 9, 7 and 7 groups, respectively. The results of this study indicated genetic relationship among DNA polymorphic patterns with geographic regions and the severity of fumonisin B1 (FB1) production. It seems that RAPD analysis is a suitable technique for strain typing of F. verticillioides.