ژنوتايپينگ سويه هاي سودوموناس آيروژينوزاي ايزوله شده از بيماران سوختگي دو بخش زنان و مردان بيمارستان طالقاني اهواز با روش RAPD-PCR

زمينه: سودوموناس آيروژينوزا يكي از عوامل اصلي عفونت هاي فرصت-طلب، به ويژه در بيماران دچار ضعف سيستم ايمني و در بخش هايي نظير ICU و سوختگي مي باشد، كه در صورت عدم رعايت نكات بهداشتي لازم، به سرعت كلونيزه شده و انتشار مي يابد. سويه هاي كلونيزه شده، ممكن است از منابع گوناگون بوده يا منبع مشتركي داشته باشند. هدف از اين مطالعه، ارزيابي ارتباط بين سويه هاي مختلف سودوموناس آيروژينوزا در بيماران سوختگي با روش ژنوتايپينگ مولكولي RAPD-PCR (Random Amplified Polymorphic DNA) مي باشد. روش: از 70 ايزوله مشكوك به سودوموناس آيروژينوزاي جمع آوري شده، 44 سويه با استفاده از تست هاي بيوشيميايي تاييد شدند. تكنيك RAPD-PCR با استفاده از پرايمر كوتاه 272، الگوهاي الكتروفورزي تكرارپذير به وجود آورد و ارتباط ژنتيكي بين سويه ها، مورد ارزيابي قرار گرفت. نتايج: انگشت نگاري ژنتيكي با تكنيك RAPD-PCR، 13 الگوي باندي با طول bp 2700-180 نشان داد. هر ايزوله بين 3 تا 6 باند از اين 13 الگو را نشان داد كه شامل 9 ژنوتيپ مختلف (I-IX) مي شد. بيشترين فراواني مربوط به ژنوتيپ I و كمترين فراواني مربوط به ژنوتيپ هاي Vو VIII، به ترتيب با (20%) ايزوله باكتري و (5%) ايزوله باكتري بود. نتيجه گيري: نتايج نشان داد اين روش ابزار ژنوتيپ بندي با قدرت افتراق بالا در مطالعات اپيدميولوژي و پلي مورفيسم سويه هاي سودوموناس آيروژينوزا مي باشد. با توجه به داده هاي اين مطالعه، بر نياز جدي به كنترل منابع عفونت در بخش هاي سوختگي، جهت كنترل و پيشگيري از انتقال اين باكتري تاكيد مي شود.

Background: Pseudomonas aeruginosa is a major health hazard particularly in immunodeficient patients, patients in ICU and burn units. It may be originated from different sources, and comprises a high colonization and transmission capacity. The present study aimed to investigate the genotypic variation of Pseudomonas aeroginosa strains isolated from burn patients using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) method. Methods: Within 70 clinical samples collected from burn patients in Taleghani Burn Hospital , 44 samples were positive for P. aeruginosa by application of conventional tests. The RAPD-PCR method was applied according to standard method using a short single primer. The technique created repetitive electrophoresis patterns, which was used for genotypic differentiation. Results: Genetic fingerprinting of RAPD-PCR, created 13 different genotypic patterns with base pair length ranging from 180 to 2700. Each isolate roughly showed between three to six genotypic patterns. The patterns comprised nine genotypic diversity, designated as I to IX with genotype I as the most common, identified in 20% bacterial isolates. The least prevalent genotypes were V and VIII, identified in only 5% isolates. Conclusion: Based on the results, RAPD-PCR technique was found as an useful tool to investigate the genetic variation for P.aeruginosa strains. This technique is a rapid and low cost genotypic method with high discriminatory power. The results could assist the screening of original infection caused by P.aeruginosa straines with subsequent control of colonization and transmission.