تغييرات ناحيه DLoop از رشته DNA ميتوكندريايي در نژادهاي گوسفند بومي ايران

DNA ميتوكندريايي به دليل دارا بودن خصوصيات منحصر به فردي همچون توارث مادري، نرخ تكاملي نسبتاً سريع و عدم داشتن نوتركيبي يك ابزار مفيد براي مطالعه ژنتيك جمعيت مي ­باشد. 82 حيوان غيرخويشاوند از 10 نژاد گوسفند بومي ايران براي تعيين تنوع ژنتيكي مادري با استفاده از يك قطعه 685 جفت بازي در ناحيه DLoop از DNA ميتوكندريايي، مورد مطالعه قرار گرفتند. از آناليز اين ناحيه درمجموع 72 هاپلوتايپ و 123 موتاسيون تشخيص داده شد. تنوع هاپلوئيدي، تنوع نوكلئوتيدي و ميانگين تعداد تفاوت­هاي نوكلئوتيدي به ترتيب 003/0 ± 996/0، 0001/0 ± 037/0 و 23/25 برآورد شد. آناليز توالي، سطح بالايي از تنوع ژنتيكي را در ميان نژادهاي گوسفند بومي نشان داد. تجزيه واريانس مولكولي نشان داد كه 43/3 درصد از تنوع به بين جمعيت­ها و 57/96 درصد تنوع به درون جمعيت­ها مربوط مي­شود. درخت نزديكترين همجواري (NJ)، 4 هاپلوتايپ (A، B، C و E) از 5 نوع هاپلوتايپ توصيف شده در گوسفند را نشان داد. درخت فيلوژنتيكي هيچگونه ساختار ژنتيكي متمايزي را در ميان جمعيت­هاي مورد مطالعه نشان نداد، كه مي­تواند به علت وجود جريان ژني بالا و آميختگي بين جمعيت­هاي گوسفند باشد كه احتمالاً به واسطه نقل و انتقال وسيع گوسفند در طول تاريخ و وجود شجره‪هاي مادري مشابه در ميان نواحي مختلف باشد.

Mitochondrial DNA (mtDNA) has been used extensively to study population genetics because it has the unique features of maternal inheritance, a relatively fast rate of evolution and lack of recombination. A total of 82 unrelated sheep from 10 Iranian indigenous sheep breeds were investigated to determinate the maternal genetic diversity using a sequence of a 685 bp segment of the displacement loop (D-loop) of mtDNA. Analysis of this region revealed 74 haplotypes and 123 polymorphic sites. Haplotype diversity, nucleotide diversity and the average number of nucleotide differences were estimated to be 0.996 ± 0.003, 0.0372 ± 0.0001 and 25.23, respectively. The sequence analysis also revealed high level of genetic diversity among the native Iranian breeds. Analysis of molecular variance revealed that 3.43 percent of the variation is found among populations compared with 96.57 percent variation found within populations. The Neighbor-Joining (NJ) tree indicated four (A, B, C and E) of the five haplogroups described so far are present in Iranian sheep breeds. The phylogenetic tree did not show any distinct genetic structure among the studied populations, which suggested that there existed strong gene flow and intermixing among sheep populations probably caused by extensive transportation of sheep in history and similar maternal lineages among the regions.