Author/Authors :
Kharrati Koopaee، H. نويسنده Institute of Biotechnology,,Shiraz University,Shiraz,Iran خراتي كوپايي, ح. , Pasandideh، M. نويسنده Faculty of Animal Science and Fishery,Department of Genetics and Animal Breeding,Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University,Sari,Iran پسنديده, م. , Dadpasand، M. نويسنده Faculty of Agriculture,Department of Animal Science,Shiraz University,Shiraz,Iran دادپسند, م. , Esmailizadeh Koshkoiyeh، A. نويسنده Faculty of Agriculture,Department of Animal Science,Shahid Bahonar University of Kerman,Kerman,Iran اسماعيلي‌زاده كشكوئيه, ع. , Mohammad Abadi، M.R. نويسنده Faculty of Agriculture,Department of Animal Science,Shahid Bahonar University of Kerman,Kerman,Iran محمدآبادي, م. ر.
Abstract :
اين پژوهش با هدف بررسي ارتباط ژن‌هاي كانديداي DGAT1، OPN و PPARGC1A با صفات توليد شير در جمعيت گاوهاي هلشتاين ايران انجام شد. مقالات زيادي چندشكليها و ارتباط آنها را با صفات اقتصادي در گاوهاي شيري مورد تحقيق قرار دادهاند اما تاكنون اثر تركيبي اين ژنها در گاوهاي هلشتاين ايران بررسي نشده است. نمونههاي خون از 398 رأس گاو هلشتاين تهيه شدند. استخراج DNA با روش نمكي انجام شد. از تكنيك PCRRFLP براي تعيين ژنوتيپ SNPها استفاده شد. بيشترين فراواني ژنوتيپي به اندازه 65/0 برايPPARGC1A (c.1892)CT و كمترين فراواني ژنوتيپي به اندازه 09/0 براي DGAT1KK به دست آمد. فراوانيهاي آللي در دامنه 36/0 تا 64/0 به ترتيب براي آللهاي A و C در جايگاه PPARGC1A (c.3359) تعيين شد. اثرات جايگزيني آللي با استفاده از مدل رگرسيون چندگانه تخمين زده شد. اثرات جايگزيني آللي ژن‌هاي DGAT1K و PPARGC1A (c.1892)Tبراي ارزشهاي اصلاحي درصد چربي شير در سطح 01/0 معنيدار بودند. همچنين نتايج آناليز چند متغيره اثر معنيدار DGAT1 و PPARGC1A (c.1892) روي ارزشهاي اصلاحي درصد چربي شير را در سطح 05/0 نشان داد. اما ارتباطي بين چندشكليهاي OPN و PPARGC1A (c.3359) با صفات مورد مطالعه وجود نداشت.
Abstract :
The aim of this study was to investigate effects of DGAT1, OPN and PPARGC1A candidate genes on milk production traits in Iranian Holstein cattle. Several papers have studied single nucleotide polymorphisms (SNPs) and their association with economic traits in dairy cows, but the combined effect of these genes has not been examined in Iranian Holstein cattle population. Blood samples were collected from 398 registered Holstein cows. Total DNA was extracted using the salting out protocol. The PCRRFLP technique was used for SNPs genotyping. The largest genotype frequency was estimated as 0.65 for PPARGC1A (c.1892)^CT and the least frequency was estimated as 0.09 for DGAT1^KK genotype. The allele frequencies were in the range 0.36 to 0.64 for PPARGC1A (c.3359)A and Calleles,respectively. The allelic substitution effects were estimated using a multiple regression model. The effects of allelic substitution for DGAT1^K and PPARGC1A (c.1892)^T were significant on estimated breeding values for fat percentage (EBVFP) (P<0.01). In addition, the results of multivariate analysis indicated the significant effect of DGAT1 and PPARGC1A (c.1892) on EBVFP (P<0.05). However, there were no association between OPN and PPARGC1A (c.3359) polymorphisms and studied traits.
Keywords :
DGAT1 , Holstein , OPN , PPARGC1A
