Other language title :
Association between Insulin–Like Growth Factor I Polymorphism and Early Growth Traits in Iranian Zandi Sheep, Found Polymerase Chain Reaction Restriction Fragment Length Polymorphism (PCRRFLP)
Title of article :
رابطه بين چندشكلي ژن فاكتور 1 رشد شبه انسولين و صفات اوليه رشد در گوسفند نژاد زندي بر اساس تكنيك PCRRFLP
Author/Authors :
Nazari، F. نويسنده Faculty of Agriculture,Department of Animal Science,Islamic Azad University, Karaj Branch,Karaj,Iran نظري, ف. , Noshary، A. نويسنده Faculty of Agriculture,Department of Animal Science,Islamic Azad University, Karaj Branch,Karaj,Iran نوشري, ع. , Hemati، B. نويسنده Faculty of Agriculture,Department of Animal Science,Islamic Azad University, Karaj Branch,Karaj,Iran همتي, ب.
Issue Information :
فصلنامه با شماره پیاپی سال 2016
Abstract :
صفات اوليه رشد در گوسفند از نظر اقتصادي داراي اهميت هستند. اصلاح نژاد براي اين صفات با استفاده از روشهاي ژنتيك كمي به ويژه در گلههاي بومي گوسفند با مشكلات زيادي مواجه است. ژنتيك مولكولي يكي از ابزارهاي كارآمد در اصلاح نژاد گوسفند محسوب ميشود. ژن فاكتور 1 رشد شبه انسولين (IGF1) يكي از ژنهاي كانديداي مهم براي صفات اوليه رشد در گوسفند شناخته شده است. هدف اين تحقيق بررسي چندشكلي در اگزون شماره 1 اين ژن و رابطه اين چندشكليها با عملكرد صفات اوليه رشد در گوسفندان زندي كشور ايران ميباشد. براي اين منظور تعداد 120 رأس از برههاي نر و ماده در سن تا 5 ماهگي به طور تصادفي انتخاب شدند و خونگيري به صورت انفرادي از آنها انجام شد. همچنين ركوردهاي فنوتيپي از دامداريهاي مربوطه جمعآوري گرديد. استخراج DNA به روش نمكي انجام شد. واكنش زنجيرهاي پليمراز (PCR) براي تكثير ناحيه 265 bp اگزون 1 ژن IGF1 انجام شد و سپس با استفاده از آنزيم برشي HaeII تعيين ژنوتيپ انجام گرديد. نتايج اين تحقيق نشان دهنده وجود دو آلل شامل A وB بود. بررسي با استفاده از نرم افزار PopGene32 فراواني آللهاي A و B را به ترتيب 47/0 و 53/0 نشان داد. فراوانيهاي ژنوتيپي براي سه ژنوتيپ AA، AB و BB به ترتيب 33/28، 50/37 و 17/34 بود. همچنين آزمونهاي كاي مربع و جي مربع نشان داد جمعيت در تعادل هاردي واينبرگ قرار ندارد (01/0>P). مطالعه ارتباط با استفاده از نرم افزار SAS 9.2 نشان داد اثر ژنوتيپهاي IGF1 روي هيچ يك از صفات اوليه رشد شامل وزن تولد، وزن 5 ماهگي و ميانگين افرايش وزن روزانه تولد تا 5 ماهگي معنيدار نيست. با اين حال ژنوتيپ AA با عملكرد بيشتر براي وزن تولد داراي ارتباط بود. چندشكليهاي ژن IGF1 بايد به عنوان يك نشانگر مولكولي در كنار اثر ساير پلي ژنهاي مربوط به صفات رشد در برنامههاي اصلاح نژاد در گوسفندان بومي مورد بررسي قرار گيرد.
Abstract :
Early growth traits in sheep are economically important. Breeding for these traits has been shown to be problematic using quantitative genetic methods, particularly in native sheep herds. Molecular genetics is useful for sheep breeding. The gene for insulin-like growth factor 1 (IGF1) is one of the important candidate genes known for ovine early growth traits. The aim of this study was to investigate IGF1 polymorphism in exon 1 and its association with some early growth traits in Iranian Zandi sheep. For this purpose, 120 male and female lambs were selected randomly at up to 5 months old and blood samples were taken individually. Also, phenotypic records were collected from related farms. Genomic DNA was extracted by a salting-out method. A 265 bp region in exon 1 of IGF1 was amplified by polymerase chain reaction (PCR), then genotyped using the restriction endonuclease HaeII. Two alleles, here called A and B, were found. Examination using PopGene32 showed allele frequencies of 0.47 A and 0.53 B. Genotype % frequencies were 28.33 AA, 37.50 AB and 34.17 BB. Chi-squared and G-squared tests showed that the popu-lation was not at Hardy-Weinberg equilibrium (P<0.01). An association study in SAS 9.2 found no significant effect of IGF1 genotype on any of these early growth traits: birth weight, average daily gain up to age five months and weight at age five months. However the AA genotype was linked to the highest values of birth weight. IGF1 polymorphism should be investigated as a molecular marker along with other polygene effects for growth traits in native sheep breeding programs.
Keywords :
Genotype Frequency , Zandi sheep , <i>IGF1</i> , early growth traits , allele frequency ,
Journal title :
Iranian Journal of Applied Animal Science
Journal title :
Iranian Journal of Applied Animal Science