Other language title :
Molecular characterization of recent Iranian infectious bronchitis virus isolates based on S2 protein gene
Title of article :
ژنوتايپينگ و تقسيم بندي ويروس هاي برونشيت عفوني پرندگان بر اساس ژن كد كننده پروتئين S2و تقسيم بندي ويروس هاي برونشيت عفوني پرندگان بر اساس ژن كد كننده پروتئين S2
Author/Authors :
Nazemi، K. نويسنده Faculty of Veterinary Medicine,Department of Microbiology and Immunology,University of Tehran,Tehran,Iran ناظمي, كامران , Ghalyanchi Langeroudi، A. نويسنده Faculty of Veterinary Medicine,Department of Microbiology and immunology,University of Tehran,Tehran,Iran قليان چي لنگرودي, آرش , Hashemzadeh، M. نويسنده Department of Research and Production of Poultry Viral Vaccine,Razi Vaccine and Serum Research Institute,Karaj,Iran هاشم زاده, مسعود , Karimi، V. نويسنده Faculty of Veterinary Medicine,Department of Avian Medicine,University of Tehran,Tehran,Iran كريمي, وحيد , Seger، W. نويسنده Faculty of Veterinary Medicine,Department of Microbiology and Immunology,University of Tehran,Tehran,Iran صگر, وليد , Ehsan، M.R. نويسنده Faculty of Veterinary Medicine,Department of Microbiology and Immunology,University of Tehran,Tehran,Iran احسان, محمدرضا
Issue Information :
فصلنامه با شماره پیاپی سال 2016
Abstract :
زمينهمطالعه: ويروس برونشيت عفوني، عاملبيماري برونشيت عفوني از عوامل مهم در ايجاد خسارات اقتصادي در صنعت طيور دنيا مي‌باشد. ويروس برونشيت عفوني به سروتيپ‌ها و ژنوتيپ‌هاي مختلفي طبقه بندي مي‌شود. پروتئين اسپايك (S) (~ 3462)،واقع در سطح غشاء ويروسي، القاء عمده‌اي از آنتيبادي‌هاي خنثي است و مسئول ويروس اتصال و ورود بهسلول‌هاي ميزبان است. جدايه‌هاي ويروس برونشيت عفوني بطور گسترده بوسيله سكانس ژن پروتيين s1 ژنوتايپينگ مي‌شوند. هدف:هدف از اين مطالعه، ژنوتايپينگ جديد وطبقه‌بندي جدايه‌هايويروس برونشيت عفوني در ايران بر‌اساس پروتيين s2 مي‌باشد. روش كار: ژن s2 نه جدايه ويروس برونشيت عفوني ابتدا توسط روش RTPCR تكثير داده شدند و مورد سكانس قرار گرفتند. سكانس آمينواسيدي اينجدايه‌ها با سكانس جدايه‌هاي غير ايراني مورد مقايسه قرار گرفتند. نتايج: جدايه‌هاي ويروس برونشيت عفوني ايران به سه ژنوتيپ (I, VII, VIII) تقسيم‌بندي گرديدند. ژنوتيپ I شامل ويروس‌هاي مشابه سروتيپماساچوست بود. ژنوتيپ VII به دو شاخه تقسيم‌بندي شدند، اولين شاخه VIIa(مشابه IS1494) و دومين شاخه VIIb نيز مربوط به ويروس‌هاي مشابه QX بودند. ژنوتيپVIIIشامل ويروس‌هاي مشابه 793/B بودند. نتيجه‌گيري‌نهايي: مطالعه حاضر نخستين اطلاعات در مورد ژنوتايپينگ و طبقه‌بندي جدايه‌هاي ويروس برونشيت عفونيايران مي‌باشد
Abstract :
Background: Avian infectious bronchitis (IB), with avianinfectious bronchitis virus (IBV) as the causing agent, is a ubiquitous endemicdisease of the chicken with devastating effects on its industry. A viralmembrane surface protein called S notonly induces neutralizing antibodies but also plays an important role in virusbinding and entry to host cells. Technically, S1 protein gene sequencing alsohelps greatly in IBV genotyping. OBJECTIVES: The aim of this study wasto characterize Iranian IBV based on S2 gene. METHODS: After RTPCRamplification, the S2 gene of nine Iranian IBV isolates were sequenced and thencompared with reference strains. RESULTS: The isolates were classifiedinto genotype I as Massachusetts like IB Vs, genotype VII which clustered intotwo branches, VIIa (IS1494 like IB viruses), and VIIb, and was related to QXlike viruses and Genotype VIII as 793/B like IBVs. CONCLUSIONS: As faras we know, this is the first S2based classification study on Iranian IBVisolates providing a firm experimental basis to correlate with genotypiccharacterization
Keywords :
تعيين هويت , شجره شناسي , infectious bronchitis virus , پروتئين S2 , characterization , phylogenetic study , Genotyping , Spike , اسپايك , برونشيت عفوني
Journal title :
Iranian Journal of Veterinary Medicine (IJVM)
Journal title :
Iranian Journal of Veterinary Medicine (IJVM)
