Title of article :
The Evaluation of Genomic Relationships and Diversity of Wild and Cultivated Wheats Possessing A Genome in Different Ploidy Levels Using SSR Markers
Author/Authors :
-، - نويسنده Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, University of Ilam, Ilam, Iran Kharestani, Hadi , -، - نويسنده Department of Plant Breeding and Biotechnology, Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources, Gorgan, Iran Nasrolah Nejad Qomi, Ali Asqar , -، - نويسنده Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, University of Ilam, Ilam, Iran Mehrabi, Ali Ashraf
Issue Information :
دوفصلنامه با شماره پیاپی سال 2016
Abstract :
تنوع و روابط ژنتیکی 37 گندم وحشی و زراعی (Triticum spp.) دارای ژنوم A شامل چهار T. urartu (Au)، سیزده اینکورن وحشی(AmAm)، چهار اینکورن زراعی (AmAm)، هفت گندم دروم (BBAuAu)، سه T. zhukovskyi (AtAtAmAmGG) و شش گندم نان (BBAuAuDD) بوسیله نشانگر ریزماهواره(SSR) بررسی گردید. فاصلههای ژنتیکی بوسیله روش نی و لی با استفاده از UPGMA با نرمافزار DARwin محاسبه گردید. نرم افزار MEGA برای رسم درخت فیلوژنتیک مورد استفاده قرار گرفت. سی و پنج جفت نشانگر ریزماهواره مورد استفاده قرار گرفت که 24 مورد از آنها تکثیر شد و 22 نشانگر چند شکلی (با 109 آلل) از خود نشان دادند. بیشترین قطعات تکثیر شده (11 آلل) و محتوای اطلاعات چندشکلی (9/0) برای لوکوس Xgwm165-4A بود. بیشترین و کمترین فاصله ژنتیکی درون گروهها برای T. urartu و T. zhukovskyi به ترتیب برابر با 86/0 و 55/0 بود. بیشترین شباهت بین T. urartu و گونههای اینکورن وحشی (009/0) مشاهده گردید. بیشترین عدم تشابه بین اینکورنهای زراعی و گندم نان مشاهده گردید. در میان گونه های دیپلوئید T. urartu بیشترین شباهت را به گندم دروم و گندم نان داشت.
Abstract :
Genomic relationships and diversity of 37 wild and cultivated wheat (Triticum sp.) possessing A genome include four T. urartu (Au), thirteen wild einkorn (Am), four cultivated einkorn (Am), seven durum wheat (BBAuAu), three T. zhukovskyi (AtAtAmAmGG) and six common wheat (BBAuAuDD) were evaluated by simple sequence repeats (SSR) analysis. Genetic distance was calculated by Nei and Li using UPGMA for construct phylogenetic tree. 24 out of 35 primer pairs amplified and 22 pairs produced polymorphic amplicons (109 alleles). The highest amplified fragments (11 alleles) and polymorphism information content (0.90) was for Xgwm165-4A locus. The highest and the lowest genetic distance within groups for T. urartu and T. zhukovskyi were 0.86 and 0.55, respectively. The most similarity was between T. urartu and wild einkorn species (0.009). The highest dissimilarity observed between cultivated einkorn and common wheat,although T. urartu was more close to durum and common wheat than other diploid species.
Journal title :
Journal of Plant Molecular Breeding
Journal title :
Journal of Plant Molecular Breeding