Other language title :
تنوع ژنتيكي سويه هاي كلستريديوم پرفرينجنس جدا شده از منابع غذايي و انساني
Title of article :
Genomic diversity of Clostridium perfringens strains isolated from food and human sources
Author/Authors :
Afshari, A Department of Nutrition - Faculty of Medicine - Mashhad University of Medical Sciences, Mashhad, Iran , Jamshidi, A Department of Food Hygiene and Public Health - Faculty of Veterinary Medicine - Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran , Razmyar, J Department of Clinical Sciences - Faculty of Veterinary Medicine - Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran , Rad, M Department of Pathobiology - Faculty of Veterinary Medicine - Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad, Iran
Abstract :
Clostridium perfringens is a serious pathogen which causes enteric diseases in domestic animals and food poisoning in humans.
Spores can survive cooking processes and play an important role in the possible onset of disease. In this study, RAPD-PCR and REPPCR
were used to examine the genetic diversity of 49 isolates of C. perfringens type A from three different sources. The results of
RAPD-PCR revealed the most genetic diversity among poultry isolates, while human isolates showed the least genetic diversity.
Cluster analysis obtained from RAPD-PCR and based on the genetic distances split the 49 strains into five distinct major clusters (A,
B, C, D, and E). Cluster A and C were composed of isolates from poultry meat, cluster B was composed of isolates from human
stool, cluster D was composed of isolates from minced meat, poultry meat and human stool and cluster E was composed of isolates
from minced meat. Further characterization of these strains by using (GTG) 5 fingerprint repetitive sequence-based PCR analysis did
not show further differentiation between various types of strains. In conclusion, RAPD-PCR method seems to be very promising for
contamination source tracking in the field of food hygiene.
Farsi abstract :
كلستريديوم پرفرينجنس، يك بيماري زاي مهم بوده كه در حيوانات اهلي، بيماري هاي گوارشي و در انسان مسموميت غذايي ايجاد مي كند. اسپورها طي فرآيند پخت زنده مانده و نقش مهمي در شروع احتمالي بيماري ايفا مي كنند. در اين مطالعه RAPD-PCR و REP-PCR براي بررسي تنوع ژنتيكي 49 ايزوله كلستريديوم پرفرينجنس تيپ A از سه منشا مختلف استفاده شدند. نتايج RAPD-PCR، بيشترين تنوع را در بين ايزوله هاي مرغي نشان داد در حالي كه ايزوله هاي انساني كمترين تنوع را نشان دادند. آناليز گروه بندي به دست آمده از RAPD-PCR و بر اساس فاصله هاي ژنتيكي، 49 ايزوله را به 5 گروه اصلي A)، B، C، D و (E تقسيم نمود. گروه هاي A و C از ايزوله هاي گوشت مرغ، گروه B از ايزوله هاي مدفوع انساني، گروه D از ايزوله هاي گوشت چرخ كرده، گوشت مرغ و مدفوع انسان و گروه E از ايزوله هاي گوشت چرخ كرده تشكيل شدند. شناسايي بيشتر اين سويه ها به وسيله آناليز انگشت نگاري (GTG) 5 بر اساس توالي هاي تكرار شده، تمايز بيشتري ميان انواع مختلف سويه ها نشان نداد. به عنوان نتيجه گيري مي توان گفت كه RAPD-PCR روشي مناسب به منظور يافتن منشا آلودگي در زمينه بهداشت و صنعت مواد غذايي مي باشد.
Keywords :
Clostridium perfringens , genetic diversity , RAPD-PCR , REP-PCR
Journal title :
Astroparticle Physics
