Title of article :
ETUDE COMPARATIVE PAR EPIFLUORESCENCE ET CYTOMETRIE EN FLUX DES COMMUNAUTES BACTERIENNES DES EAUX DE LA RETENUE DU BARRAGE SIDI SALEM (TUNISIE SEPTENTRIONALE)
Author/Authors :
BEN ROMDHANE, Samira Faculté des Sciences de Tu nis , ELBOUR, M Institut National des Sciences et Technologies de la Mer (INSTM) , HAMZA, A Institut National des Sciences et Technologies de la Mer (INSTM) , KRAIEM, M.M Institut National des Sciences et Technologies de la Mer (INSTM)
Abstract :
Deux techniques de comptage par microscopie en épifluorescence et par cytométrie en flux ont été utilisées pourévaluer la variabilité spatio
-temporelle des communautés bactériennes dans les eaux de la retenue du barrage Sidi Salem. Ceci, concerne les populations hétérotrophes englobant les formes cultivables et les formes viables non cultivables (VNC) en tenant compte de l’influence des paramètres du milieu (température, transparence,oxygène dissous et sels nutritifs). Ainsi, un suivi mensuel a été établi pendant deux ans (de février 2009 jusqu’à
janvier 2011), pour analyser des échantillons d’eau prélevés en amont, en aval et dans la tour de prise delaretenue.
Les résultats obtenus montrent que l’observation en épifluorescence révèle toutes les formesbactériennes viables non cultivables, dont ’abondance se situe entre 5,3 x104 et 1,2x106cell/ml. Aussi, nous
avons enregistré des charges bactériennes maximales en période automnale et printanière notamment au niveau
de la tour de prise. Par ailleurs, la charge bactérienne totale en amont de la retenue est plus élevée que celle enaval et présente une corrélation significative avec certains facteurs physico-chimiques (pH, oxygène dissous,azote totale et chlorophylle a).
Pour l’analyseencytométrie, les populations bactériennes sont séparées selon l’état de l’ADN en «Low DNA»(LDNA)et «High DNA» (HDNA) avec des abondances respectives variantentre 1,3x105 et 4x107cell/ml et6x10
4 à 2x107 cell/ml. Ces résultats soulignent la grand e diversité ctérienne présente dans la retenue dubarrage Sidi Salem en fonction des caractéristiques environnementales.
Abstract :
Comparative
study
with epifluorescence microscopy
and flow cytometry
of the bacterial communities of
water retention of the Sidi Salem dam ( North of Tunisia )
:
Two counting techniques by epifluorescence
microscopy and flow cytometry were used to assess the spatial and t
emporal variability of bacterial communities
in the Sidi Salem reservoir. This concerned the heterotrophic populations, including the cultivable forms and
viable non cultivable (VNC) once; taking into account the influence of environmental parameters (temp
erature,
transparency, dissolved oxygen and nutrients). Thus, a monthly monitoring has been followed during two years
(February 2009 to January 2011), to analyze water samples upstream, downstream and into the deepest area of
the reservoir. The results sho
w that the observation by epifluorescence microscopy reveals all viable non
- cultivable forms of bacteria, including their abundance ranges from 5.3 x 10
4
to 1.2 x 10
6
cells / ml. Also, we
recorded the maximum bacterial loads during autumn and spring, espec
ially at the deepest station of the
reservoir. Otherwise, bacterial loads upstream of the reservoir are higher than those of downstream and
significantly correlated with some physico
-
chemical factors (pH, dissolved oxygen, total nitrogen and
chlorophyll a)
.
For cytometric analysis, bacterial populations are separated according to the state of the DNA "Low DNA"
(LDNA) and "High DNA" (HDNA) with respective abundance ranging between 1.3 x10
5
and 4x10
7
cells / ml
and from 6x10
4
to 2x10
7
cells / ml. These resu
lts emphasize the high bacterial diversity in the Sidi Salem dam
based on the environmental characteristics.
Arabic abstract :
دراسة مقارنة المجموعات البكتيريا المتواجدة ببحيرة سد سيدي سالم
)
شمال تونس
(
باستخدام المجھر
épifluorescence
والتدفق الخلوي
:
تھدف
ھذه الدراسة
,
تقييم التغير المكاني والزمني للمجموعات الجرثومية أساسا
)
البكتيريات
(
في بحيرة سد سيدي سالم
.
مع الأخذ بعين الاعت
بار تأثير العوامل البيئية
)
درجة حرارة الماء
,
الشفافية
,
الأوكسجين والمواد المغذية
.(
وقعت المتابعة الشھرية على مداد سنتين
)
من فيفري
2009
الى جانفي
2011
(
لعينات المياه
المأخوذة من المنبع
,
ومن المصب ومن وسط برج تجمع المياه في البحيرة
.
و قد تم تحليل وفرة و تو
زيع البكتيريا عن طريق
الاستخدام المشترك للمجھر و التدفق الخلوي
.
أظھرت النتائج المتحصل عليھا بالمجھر، الكشف عن جميع أنواع البكتيريا
)
الحية التي لا يمكن تربيتھا اصطناعيا
(
,
فكانت النسب تتراوح بين
5,3
x
10
4
و
1,2
x
10
6
خلية
/
مل
.
وتم تسجيل بلوغ
ّ
كثافة البكتيريا ال
متواجدة في العينات المأخوذة من وسط خزان السد، مستوياتھا القصوى في فترة الخريف و في فترة الربيع
لسنة
2010
.
كذلك أظھر تحليل العينات المأخوذة من منبع السد، نسبة كثافة عالية للبكتيريا، التي بدورھا وصلت الى أعلى
درجاتھا في الفترة الشتوية لسنة
2010
، مقارنة بالعي
ينات التي أخذت من المصب ، لكن تميزت ھذه الأخيرة بعلاقة ھامة
بين مجموعات البكتيريا و
بعض العوامل الفيزيوكيميائية
)
درجة الحموضة
,
الأكسيجين
,
مجموع النيتروجين و
اليخضور
"
أ
. ("
بعد تحليل مجموعات البكتيريا بطريقة التدفق الخلوي تمكنا من ملاحظة تباعد واضح بين
LDNA
و
HDNA
، بكثافة تتراوح على التوالي من
1,3
x
10
5
الى
4
x
10
7
خلية
/
مل و من
6
x
10
4
الى
2
x
10
7
خلية
/
مل
.
يبين ھذا البحث أنھ يمكن دراسة توزيع مختلف المجموعات البكتيرية وتعدادھا بطريقتين
,
ومدى ارتباطھا بأھم العوامل
الفيزيو
-
كيميائية حتى يتسنى تقدير و لأول مرة
، أھمية التنوع البيولوجي و البيئي للمجموعات الجرثومية وخاصة منھا
البكتيرية لبحيرة سد سيدي سالم
.
Keywords :
cytomètre en flux , microscope en épifluorescence , bactéries , La retenue du barrage Sidi Salem
Journal title :
Astroparticle Physics