Other language title :
جداسازي و مطالعه ويژگي هاي فنوتيپي و مولكولي گونه هاي آئروموناس هاي متحرك عامل سپتيسمي هموراژيك باكتريايي در برخي مزارع مبتلاي كپور ماهيان پرورشي كشور
Title of article :
Isolation, phenotypic and molecular characterization of motile Aeromonas species, the cause of bacterial hemorrhagic septicemia in affected farmed carp in Iran
Author/Authors :
Soltani, M. Department of Aquatic Animal Health - Faculty of Veterinary Medicine - University of Tehran, Tehran , moghimi, M. Department of aquatic animal health - Faculty of veterinary medicine - University of Tehran, Tehran , Ebrahimzadeh mousavi, H Department of aquatic animal health - Faculty of veterinary medicine - University of Tehran, Tehran , Abdi, K. Aquatic animal health expert - Directorate of health and control of aquatic animal diseases - Iranian veterinary organization , Soltani, E. Department of microbiology - faculty of science - university of Tehran, Tehran
Abstract :
Background: Motile Aeromonas species cause heavy
mortalities in carp farms during spring and summer in Iran. Objectives: The aim of this study was to detect phenotypic
and genotypic characterization of motile Aeromonas species isolated from
diseased carps in some northern and southern provinces of Iran. Methods: A number of 40 samples from 22 fish farms were
collected. The identified motile Aeromonas species were sequenced and
phylogenetic tree was drawn by MEGA6 using UPGMA analysis. Results: A number of 19 bacterial isolates were
identified as motile Aeromonas sp. by biochemical tests, and the DNA
segments of 16S rRNA gene of all these strains gave 1200 bp after running on 1%
agarose electrophorus gel. Also, the sequencing results showed that the
bacterial samples were determined as A. hydrophila and A. veronii
biovar veronii. Conclusions: Phylogenetic analysis revealed that motile Aeromonas
strains in this study were separated in two clusters and four genogroups with high similarities
Farsi abstract :
زمينه مطالعه: آئروموناس‌هاي متحرك عامل تلفات سنگين در مزارع پرورش كپورماهيان ايران در فصول بهار و تابستان مي‌باشند. هدف: هدف از انجام مطالعه حاضر جداسازي و شناسايي ويژگي‌هاي فنوتيپي و مولكولي گونه‌هاي آئروموناس‌هاي متحرك در برخي از مزارع پرورشي كپورماهيان كشور بوده است. روش كار: به اين منظور نمونه‌هاي بافت كليه 40 نمونه ماهي داراي علائم باليني از 22 مزرعه مورد بررسي قرار گرفت. پس از كشت از بافت كليه ماهيان بيمار روي محيط ژلوز خوندار، آزمايش‌هاي بيوشيميايي جهت شناسايي جنس‌هاي باكتريايي انجام شد. به منظور تأييد تشخيص پس از استخراج DNA نمونه‌ها و ارزيابي كيفيت DNAهاي استخراج‌شده، آزمايش PCR صورت گرفت. در اين آزمايش از يك جفت آغازگر براي شناسايي ژن 16S rRNA باكتري استفاده شد. نمونه‌هاي تأييد‌شده تعيين توالي گرديد و مطالعات فيلوژنتيك بر روي جدايه‌ها با استفاده از نرم‌افزار MEGA نسخه 6 انجام شد. نتايج: از كل نمونه‌هاي مورد مطالعه 19 نمونه به عنوان گونه‌هاي آئروموناس‌هاي متحرك با استفاده از آزمايش‌هاي بيوشيميايي و نيز توليد باند 1200 بازي از ژن موردنظر روي ژل الكتروفور 1% شناسايي شدند. پس از تعيين توالي، اين گونه‌ها به عنوان Aeromonas hydrophila و A. veronii biovar veronii تشخيص داده شد. نتيجه‌گيري نهايي: مطالعات فيلوژنتيك نشان داد كه سويه‌هاي آئروموناس‌هاي متحرك مورد مطالعه در دو خوشه و چهار گروه ژنتيكي قرار دارند.
Keywords :
Farmed carp , Motile Aeromonas septicemia , 16S rRNA gen
Journal title :
Astroparticle Physics
