Other language title :
پروفايل هاي بياني تفكيكي مربوط به ميكرو آر.ان.ا( miRNAs) القاشده به وسيله ويروس موزائيكي تنباكو
Title of article :
Differential Expression Profiles of Tomato miRNAs Induced by Tobacco Mosaic Virus
Author/Authors :
Abdelkhalek, A Plant Protection and Bimolecular Diagnosis Department - ALCRI, City of Scientific Research and Technological Applications, Alexandria, Egypt , Sanan-Mishra, N Plant RNAi Biology Group - International Center for Genetic Engineering and Biotechnology, Aruna Asaf Ali Marg, New Delhi, India
Abstract :
Plant microRNAs (miRNAs) play important roles in plant development and responses to
biotic and abiotic stress. Recently, there is clear evidence that miRNAs are involved in
host-virus interactions. By using stem-loop RT-PCR, an expression levels change of
thirteen miRNA belonging to six miRNA families targeting leaf development and
morphogenesis were analyzed upon Tobacco Mosaic Virus (TMV)-tomato infection.
Compared to mock plants, significant changes in relative expression levels of nine
miRNAs were observed. The miR319c-5p showed the highest statistically significant
increase in accumulation at 15 days post-inoculation. At all time points tested, miR159,
miR164a-3p, miR164a-5p, miR166c-5p and miR319c-5p were up-regulated while miR160,
miR319a, miR319b, miR319c-3p were down-regulated in most cases. Our data could
provide new insights into the role of miRNAs in tomato-TMV interaction and in
developing efficient strategies for improving tomato resistance against viral infection.
Farsi abstract :
ميكرو آر.ان.ا( miRNA هاي گياهي در رشد گياه و واكنش آن به تنش هاي زنده و غير زنده نقش مهمي دارند. اخيرا، شواهد روشني به دست آمده كه نشان ميدهد miRNAsدر تعامل بين ميزبان و ويروس دخالت دارند. در اين زمينه، در پي آلودگي گوجه فرنگي با ويروس موزائيكي تنباكو (TMV)، با استفاده از روش
stem - loop RT - PCR، تغيير در سطح بيان ( expression levels change) سيزده miRNAsاز 6 فاميل miRNAs كه رشد و مورفوژنز برگ را هدف قرار ميدهند بررسي شد. تغييرات در سطح بيان نسبي 9 ميكرو آر.ان.ا( miRNAs در مقايسه با گياهان شاهد (mock plants) معنادار بود. 15 روز بعد از آلوده شدن، miR319c
- 5p بيشترين افزايش در انباشت (accumulation) را نشان داد كه از نظر آماري معنادار بود. در همه زمان هاي اندازه گيري،
miR166c - 5p miR164a - 5p miR164a - 3p miR159 و miR319c
-5p فرا تنظيم شده ( up - regulated ) بودند در حاليكه miR319b miR319a، miR160و miR319c - 3p در بيشتر موارد فرو - تنظيم شده ( down- regulated ) بودند. داده هاي اين آزمايش نگرش جديدي در مورد نقش miRNAsدر تعامل بين گوجه فرنگي و TMV و نيز براي توسعه راهبردهاي كار آمد در زمينه بهبود مقاومت گوجه فرنگي در برابر آلودگي ويروسي فراهم مي كند.
Keywords :
Viral infection , TMV , RT-PCR , Stem-loop , Host-virus interaction
