Other language title :
مطالعه تنوع ژنتيكي در سه گونه از جنس ( Rhodophyta , Gigartinales ) Hypnea با استفاده از ماركرهاي ISSR
Title of article :
Study of Genetic Variation in Three Species of Hypnea J.V. Lamouroux (Cystocloniaceae, Gigartinales) Species Using ISSR Markers
Author/Authors :
Sargazi, Fatemeh Department of Biology - University of Sistan and Baluchestan, Zahedan, Iran
Abstract :
Hypnea species were found in southern coasts of Iran. This genus is an important red
alga which comprises about 53 species worldwide and has a wide geographical
distribution on the tropical shores around the world. In Iran, about 10 species of this
genus have been reported from the subtidal zone of the Persian Gulf and Gulf of
Oman coasts. The present study considers the assessment of genetic diversity of 10
populations of 3 species of Hypnea by using 6 ISSR primers. Genetic diversity
parameters were determined among populations. The genetic divergence of the
studied populations was checked by Neighbor-Joining (NJ) and Principal component
analysis (PCA). Genetic differentiation of the studied species and populations was
studied by AMOVA (Analysis of molecular variance) test. The Mantel test was
performed to study the association between molecular distance and geographical
distance of the studied populations. Grouping of the populations by NJ clustering
separated the studied species in 2 distinct clusters. The most populations of H.
musciformis formed a separate cluster and were placed far from the other species. H.
ecklonii and H. cornuta showed some degree of relationship and were placed close to
each other. AMOVA test showed significant genetic difference among populations.
The Mantel test did not show a correlation between the genetic distance and
geographical distance of these populations
Farsi abstract :
گونه هاي هيپنه آ در سواحل جنوبي ايران يافت مي شوند. اين جنس شامل حدود 53 گونه ميباشد كه توزيع جغرافيايي وسيعي در سواحل گرمسيري سراسر جهان دارد. در ايران حدود 10 گونه از اين جنس از مناطق زير جذر ومدي سواحل درياي عمان و خليج فارس گزارش شده است. مطالعه حاضر به بررسي تنوع ژنتيكي 10 جمعيت از 3 گونه هيپنها با استفاده از 6 پرايمر ISSR مي پردازد. پارامترهاي تنوع ژنتيكي در بين جمعيت ها تعيين شد. واگرايي ژنتيكي جمعيت هاي مورد مطالعه توسط روش اتصال به نزديك ترين همسايه (NJ) و تجزيه به اجزاي اصلي (PCA بررسي شد. تمايز ژنتيكي گونه ها و جمعيت هاي مورد مطالعه توسط AMOVA (آناليز واريانس مولكولي) مورد بررسي قرار گرفت. تست مانتل براي بررسي رابطه بين فاصله ملكولي و فاصله جغرافيايي جمعيت هاي مورد مطالعه انجام شد. گروه بندي جمعيت ها توسط روش خوشه بندي NJ گونه هاي مورد مطالعه را در دو خوشه جدا قرار داد. بيشتر جمعيتهاي H . musciformis يك خوشه جداگانه را تشكيل دادند و دور از 2 گونه ديگر قرار گرفتند. H.ecklonii و H . cornuta تفاوت ژنتيكي معناداري را در بين جمعيت هايشان نشان دادند و نزديك به همديگر قرار گرفتند. روش AMOVA تفاوت ژنتيكي معناداري را بين جمعيت ها نشان داد. روش Mantel همبستگي بين فاصله جغرافيايي و ژنتيكي را در اين جمعيتها نشان نداد.
Keywords :
Hypnea , genetic diversity , Mantel test , southern coasts , ISSR