التركيب الوراثي لبعض اصناف الرز Oryza sativa باستخدام الموشرات الجزيئية

تم تنفيذ تحليل تمايز الدنا التضاعفي العشوائي (RAPD) Random Amplified Polymorphic DNA لتحضير البصمة الوراثية لــ 10 اصناف من نبات الرز. تم الكشف عن التباينات بين القطع المتضاعفة لكل صنف (اعدادها واحجامها الجزيئية) بعد ترحيل نواتج التضاعف للعينات على هلام الاكآروز وتصبيغها ببروميد الاثيديوم. تم اختيار 27 بادئا والتي اظهرت نواتج تضاعف متباينة بين الاصناف المدروسة اذ اظهرت تلك البادئات 290 حزمة متباينة Polymorphic bands من اصل 381 حزمة كلية (رئيسية). كل بادئ مختار انتج ما بين 30 حزمة (OPT-12) الى 131 حزمة (OPB-17). وتراوح حجم النواتج المتضاعفة (الحامض النووي amplicons) بين 100 زوج قاعدي (OPY-04) و(OPC-04 )الى 4000 زوج قاعدي (OPT-12). اكبر عدد من الحزم المتباينة (المتغايرة) (23 حزمة) التي نتجت بواسطة البادئ( OPA-02)في حين ظهر ان اقل عدد من الحزم المتباينة (2 حزمة) والذي نتج بواسطة البادئ (OPF-05). وقد اختلفت البادئات في قدرتها على ايجاد انواع مختلفة من النسق بين الاصناف المدروسة polymorphic RAPD profile امكن فيها ايجاد البصمة الوراثية للاصناف قيد الدراسة من الرز والتي تعكس ملامح متنوعة فردية محددة الحامض النووي (البصمات). تراوحت كفاءة البادئ بين 0.228 في (primer OPB-18) الى 0.039 في (primer OPX-15). ووجد في هذه الدراسة بان البادئ( OPA-02 )كان له اعلى قدرة على التمييز(القدرة التميزية)اما البادئ (OPT-12) كان يمتلك اعلى تعدد للاشكال polymorphism(التغاير الشكلي)، بينما البادئ OPF-05 يمتلك اقل قيمة للقدرة على التمييز. كان اقل بعد وراثي هو (0.29796) بين الصنفين او التركيبين (4) عنبر 33 و(5) برنامج 4، بينما اكبر بعد وراثي هو (0.73626) بين التركيبين (1) عنبر البركة و(6) اباء 1 في الدراسة الجزيئة، كشف التحليل التجميعي (شجرة النشوء والتطور) بطريقة ( unweighted pair-group method of arithmetic means (UPGMA اي المعتمدة على شجرة العلاقات التطورية الى مجموعتين وراثية رئيسة: مجموعة واحدة صغيرة تدعى A تحتوي على ثلاث اصناف، ومجموعة كبيرة تدعى B تحتوي على سبع اصناف اخرى.