Title of article :
Molecular typing of toxigenic Clostridum perfringens isolated from sheep in Iran
Author/Authors :
جباري، احمد رضا نويسنده بخش تحقيق و توليد واكسن‌هاي بي‌هوازي, موسسه تحقيقات واكسن وسرم سازي رازي، كرج، ايران Jabbari, A.R. , افشاري فر، ثريا نويسنده Faculty of Basic Sciences, Payame Noor University, Tehran, Iran Afshari Far, S. , اسماعيل زاد، مجيد نويسنده Department of Biotechnology, Razi vaccine and serum research institute, Karaj, Iran Esmaelizad, M. , پيله چيان لنگرودي، رضا نويسنده , , موسوي شوشتري، محسن نويسنده موسسه تحقيقات واكسن و سرم سازي رازي, , , عبدالمحمدي خياو، ليدا نويسنده Department of Anaerobic bacterial vaccine research & production, Razi vaccine and serum research Abdolmohammadi Khiav1, L.
Issue Information :
دوفصلنامه با شماره پیاپی 0 سال 2011
Abstract :
در اين مطالعه يك روش مولكولي مبتني بر واكنش زنجيرهاي پليمراز براي تايپينگ كلستريديوم پرفرينجنز راه اندازي شده و سپس نسبت به تعيين تيپ64 نمونه كلستريديوم پرفرينجنز جدا شده از گوسفند و بزدر ايران اقدام گرديد . با استفاده از روش واكنش زنجيرهاي پليمراز ژن‌هاي آلفا، بتا و اپسيلون تكثير يافته و ژنوتيپ هاي A، B، C و D مورد شناسايي قرار گرفتند. تعداد 9 عدد (07/14%) از جدايه هاي آزمايش شده در ژنوتيپ هاي A ، 20 نمونه (25/31%) در ژنوتيپ B ، 17 نمونه (5/26%) در ژنوتيپ C و 18 نمونه (1/28%) در ژنوتيپ D قرار گرفتند. قطعات مرتبط با هريك از توكسين هاي آلفا ، بتا و اپسيلون با يك جفت پرايمر اختصاصي كه ابتدا روي سويه هاي رفرانس ( واكسينال ) آزمايش گرديد تكثير داده شدند . در سيستم واكنش زنجيرهاي پليمراز استفاده شده در اين مطالعه قطعه مرتبط با ژن توكسين هاي آلفا ، بتا و اپسيلون به ترتيب 900 ، 611 و 402 جفت باز طول داشتند. هويت قطعات محصول واكنش زنجيرهاي پليمراز ژن‌هاي آلفا ، بتا و اپسيلون به روش سيكونسينگ و مقايسه آنها در بانك ژن تاًييد گرديد. نتايج حاصل از Alignment نشان دهنده تشابه بالاي 98% بين توالي حاصل از سويه‌هاي رفرانس اين مطالعه با توالي هاي موجود در بانك ژن مي باشد. نتايج اين تحقيق نشان داد كه ژنوتايپينگ به روش واكنش زنجيرهاي پليمراز براي تايپينگ كلستريديوم پرفرينجنز ابزار آزمايشگاهي مناسبي مي‌باشد.
Abstract :
In this research a molecular method based on polymerase chain reaction for typing of Clostridium
perfringens was developed and toxin genotypes of 64 isolates from sheep and goats in Iran were
determined. The PCR assays were developed for detection of alpha (cpa), beta (cpb) and epsilon (etx)
toxin genes, allowing classification of the isolates into genotypes A B, C and D. The field isolates were
assigned to genotypes A (n=9, 14.07 %), B (n=20, 31.25%), C (n=17, 26.56%) and D (n=18, 28.12%). In
this PCR system the fragments of 900, 611 and 402 bp were amplified using specific primers for alpha,
beta and epsilon toxins, respectively. The fragments were confirmed by sequencing and blasting in
GenBank. The sequence alignment of the fragments showed more than 98% similarity with other related
published sequences from other sources. Our results suggest that PCR genotyping is an acceptable tool
for in vitro typing of C. perfringens.
Journal title :
Archives of Razi Institute
Journal title :
Archives of Razi Institute
